分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2024-05-15 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为揭示木薯连作障碍形成机制，该研究以定点大田连作木薯三年，利用高通量测序技术和生物 信息学手段研究连作年限对木薯根际与非根际土壤真菌群落结构演替的影响。结果表明：（1）连作对木 薯根际与非根际土壤真菌群落α多样性及群落的分类和发育系统β多样性影响显著。（2）木薯的主要优势 菌门是子囊菌门、SAR 超类群、担子菌门、毛霉门和unclassified_k__Fungi，主要优势菌纲为粪壳菌纲、 散囊菌纲、座囊菌纲和Intramacronucleata。非根际土壤中，子囊菌门组成变化较大，从第一年的漆斑菌 属、粪壳菌纲、座囊菌纲向单一的Knufia 属演化；根际土壤的真菌则从子囊菌门的肉座菌目、刺盾炱目、 漆斑菌属、座囊菌纲、粪壳菌纲向norank_d__Eukaryota 门Monosiga 属演化。（3）土壤pH、有机质含 量、碱解氮含量、有效磷含量、速效钾含量、过氧化氢酶活性对土壤真菌群落变化影响显著，尤其影响 子囊菌门、SAR 超类群、担子菌门和毛霉门的分布。综上所述，木薯连作会引起根系分泌物累积，改变 土壤理化性质及真菌的生存环境，进而引起真菌群落多样性和丰富度的变化；其中，非根际土壤中子囊 菌由漆斑菌属、粪壳菌纲、座囊菌纲向单一的Knufia 属演变；根际土壤中子囊菌门的肉座菌目、漆斑菌 属、粪壳菌纲等有益真菌的相对丰度随连作年限的增加而降低，进而引发木薯连作障碍。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-12-19 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 该研究旨在克隆 Ty1-copia 类反转录转座子 RT 基因，为分离花生属 Ty1-copia 类反转 录转座子全长序列和研究其功能提供序列基础。根据RT 基因的保守区设计简并引物，以两 份 AA 染色体组野生种花生“Arachis duranensis”为试材，利用 PCR 扩增其基因组 DNA，回 收、克隆和测序目的条带后，对所获得序列进行生物信息学分析。结果表明：（1）目的条 带大小约为 260 bp 大小，分别从两份野生种花生材料中克隆到 41 条和 27 条 RT 基因序列， 68 条序列的长度变化范围为 256 ~270 bp，AT 所占比例范围为 55.86%~68.42%，AT 与 GC 比例范围为 1.27~2.17，核苷酸序列间相似性范围为 49.8%~99.2%，存在较高异质性。（2） 68 条序列被划分为 6 个家族，家族Ⅰ和Ⅳ为主要成分。（3）68 条序列中的 19 条发生了无 义突变，Arachis duranensis（PI219823）要比 Arachis duranensis（PI262133）的无义突变率 高。（4）氨基酸序列间相似性范围为 4.7%~100%，呈现高度异质性。（5）各家族中代表 序列的蛋白质三级结构在整体构型上一致，但在螺旋结构数、折叠结构数、转角数和氢键数 上存在较大差别。（6）序列间保守基序总体一致，但也存在一定变异，呈现一定异质性； 系统进化树将 68 条序列分为 10 类，大部分序列都聚在 A 和 B 两大类中。（7）另有部分 AA 染色体组野生种花生的 RT 基因序列与其他物种植物的 RT 基因序列亲缘关系较近，推 测不同物种植物之间可能发生过 Ty1-copia 类反转录转座子的横向传递。该研究为花生属基 于 Ty1-copia 类反转录转座子的新分子标记开发和应用奠定基础。
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