分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2024-05-15 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 澳洲坚果（Macadamia integrifolia）是一种高经济价值的常绿坚果树，其果仁富含 脂肪酸和蛋白等营养成分。为鉴定澳洲坚果果仁中与营养成分形成相关基因，该研究采用转 录组学、基因克隆、荧光定量和生物信息学等技术从澳洲坚果果仁营养成分含量显著差异品 种‘桂热1 号’和‘A4’的果仁转录组中挖掘调控基因。结果表明：（1）转录组分析发现‘桂热 1 号’相比‘A4’果仁中上调基因1 667 个，下调基因1 798 个，KEGG 富集分析发现差异基因 主要在淀粉和糖代谢、氨基酸生物合成和碳代谢路径。（2）发现一个差异表达基因 gene-LOC122077931 编码R2R3-MYB 转录因子MYB44L，并采用RACE 技术在‘桂热1 号’ 果仁中克隆了MiMYB44L，其全长1 165 bp，ORF 长度999 bp，编码332 个氨基酸。（3） 采用生物信息学技术证明MiMYB44L 含有R2R3-MYB 家族特征的SANT 结构域，不含有 信号肽和跨膜结构域，含有磷酸化位点。（4）测定了10 个澳洲坚果品种果仁中蛋白质含量， 发现MiMYB44L 在澳洲坚果高蛋白含量品种中表达显著高于其在低蛋白含量品种中的表达 量，整体相关系数0.54，达到极显著水平。该研究结果为深入解析MiMYB44L 在澳洲坚果 营养成分形成中的调控作用机制提供理论指导。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2024-05-15 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 通气组织是水母雪兔子（Saussurea medusa）应对极端环境的适应性结构，其形成 通常伴随着细胞程序性死亡（programmed cell death，PCD）的发生，而细胞的死亡与通气 组织的形成通常受到PAD4 基因（Phytoalexin deficient 4）的调控，但PAD4 如何调控水母雪 兔子通气组织形成的机制仍不明确。本研究以水母雪兔子为试验材料，利用同源克隆和 RACE 技术克隆了通气组织形成相关基因SmPAD4，对其序列、系统进化、表达和亚细胞定 位等进行分析，并采用hi-1IL PCR 技术扩增其启动子，以探讨该基因在环境适应中的功能。 结果表明:（1）SmPAD4 基因cDNA 全长为2 047（GenBank 登录号为OR766038），包括1 866 bp 的开放阅读框，编码621 个氨基酸，分子式（C3163H4906N848O910S26），该蛋白为碱性 亲水性不稳定蛋白。（2）系统进化树分析显示，SmPAD4 与刺苞菜蓟（Cynara cardunculus） CcPAD4 的氨基酸序列相似度最高。（3）扩增出1 049 bp 的SmPAD4 启动子序列，包含有 光响应元件、低氧应答元件、干早、生长素应答元件等顺式作用元件。（4）实时荧光定量 分析显示，SmPAD4 基因在根、茎和叶中均有表达，且在叶中的表达量最高；在紫外和低氧 胁迫下SmPAD4 基因在叶和茎中表达量均上调，根中表达量下调。（5）亚细胞定位显示， SmPAD4 分布于细胞核、细胞膜和叶绿体。该研究表明，SmPAD4 基因拥有独特的蛋白结构 域，并且响应低氧和紫外两种环境胁迫，在通气组织的形成以及对逆境胁迫的响应中具有重 要作用，为进一步探究SmPAD4 基因在水母雪兔子环境适应过程中的作用提供理论依据。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2024-04-17 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 膨胀素（expansin，EXP）通过调控细胞壁的松弛在植物应对环境胁迫过程中起着 重要作用。为研究EXP 基因在大豆应对非生物胁迫过程中的作用，对大豆中的两个EXP 基 因（GmEXPB5 和GmEXPB7）及其蛋白序列进行生物信息学分析，通过实时荧光定量PCR （qRT-PCR）检测基因表达量。结果表明：(1) GmEXPB5 和GmEXPB7 分别位于大豆第10 和12 号染色体上，编码的蛋白序列长度分别为272 和267 个氨基酸。GmEXPB5 蛋白分子 量为29.07 kD，理论等电点为7.51；GmEXPB7 蛋白分子量为29.09 kD，理论等电点为8.66。 GmEXPB5 和GmEXPB7 均为稳定的亲水蛋白且定位于细胞壁中。GmEXPB5 和GmEXPB7 蛋白均含有一段信号肽序列和一个保守的DPBB_1 结构域。(2) GmEXPB5 蛋白与鹰嘴豆 CaEXPB15 蛋白亲缘关系最近，GmEXPB7 蛋白与密花豆、赤豆和豇豆的EXPB3 蛋白有着 较近的亲缘关系。(3) GmEXPB5 和GmEXPB7 在大豆根、茎和叶中均表达且它们在根和叶中 的表达量均显著高于茎中的表达量。(4) GmEXPB5 和GmEXPB7 在大豆幼苗中可以响应盐、 干旱和低温胁迫。(5) GmEXPB5 启动子区域含有两种与逆境相关的顺式作用元件（ABRE 和 ARE）；GmEXPB7 启动子区域含有五种与逆境相关的顺式作用元件（ABRE、ARE、 CGTCA-motif、TC-rich repeats 和MBS）。上述结果表明，GmEXPB5 和GmEXPB7 能够参 与大豆对非生物胁迫的应答。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2023-12-24 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 弄清蛇足石杉COBRA 基因家族成员分子生物信息学特征及组织表达规律，为 COBRA 基因进一步研究提供依据。基于蛇足石杉的全长转录组数据，通过生物信息学技术 对该家族成员（HsCOBRAs）的理化性质、结构域、保守基序、顺式作用元件、基因表达量 等进行分析。结果表明：（1）在蛇足石杉全长转录组中共筛选出24 个HsCOBRAs 家族成 员，其中酸性蛋白9 个，稳定蛋白11 个，疏水性蛋白5 个，具有跨膜结构的蛋白7 个，具 有信号肽的蛋白3 个。（2）亚细胞定位在细胞壁、叶绿体、细胞核、细胞膜上。（3）结构 分析发现HsCOBRAs 有7 种结构域和6 种保守基序，部分成员具有高度保守的CCVS 结构。 （4）HsCOBRAs 具有CAAT-box、TATA-box 等46 种顺式作用元件。（5）HsCOBRA2 在叶、 孢子、茎、芽胞中的表达量均最高。蛇足石杉COBRA 基因家族分子生物信息学及表达特征 可为HsCOBRAs 的进一步研究及生物学功能验证等提供理论依据。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2022-03-30 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 晚期胚胎发育丰富蛋白（late embryogenesis abundant，LEA）与植物抗逆性密切相关，在干旱胁迫下保护植物细胞，减少植物损伤，并广泛存在于生物体内。垫状卷柏（Selaginella pulvinata）是一种在干旱胁迫下生存能力极强的蕨类植物，具有很强的恢复能力。为探究垫状卷柏SpLEA1基因在耐旱植物中的分子机制与表达特征，该研究以高耐旱性植物垫状卷柏为实验材料，基于转录组测序结果，采用RT-PCR技术获得SpLEA1基因cDNA序列，采用HiTail-PCR技术获得启动子序列，利用生物信息学对序列进行了分析，采用qRT-PCR技术，分析了SpLEA1基因在干旱胁迫下的表达模式。结果表明：（1）垫状卷柏SpLEA1全长为476 bp，开放阅读框（ORF）为279 bp，共编码92个氨基酸，通过在线工具预测到蛋白分子量为9 491.46 Da, 等电点为5.45，蛋白结构预测分析表明该蛋白为亲水性蛋白，含有10个磷酸化位点，二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。（2）预测到SpLEA1蛋白的保守结构域为Lea-5，来源于LEA1家族，基于系统发生树和遗传距离矩阵，发现垫状卷柏SpLEA1与来自鹰嘴豆（Cicer arietinum ）和红三叶（Trifolium pratense）的Lea-5蛋白同源性较高。（3）利用在线工具对启动子序列进行顺式作用元件的预测分析发现SpLEA1基因启动子含有5类激素响应元件和与干旱胁迫响应有关的功能元件。（4）在自然干旱处理下SpLEA1基因表达上调并在12 h时达到峰值，在24 h干旱后进行复水处理，表达量显著下调。综上所述，SpLEA1基因在垫状卷柏中很可能参与了干旱胁迫响应机制的相关调控。此结果为进一步研究垫状卷柏SpLEA1基因在干旱胁迫下的功能及其表达调控机制奠定了基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2022-03-30 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 香蕉的矮化突变是香蕉无性繁殖后代最常见的表型变异，但其变异调控机理尚未研究清楚。内源赤霉素是影响植物株高的重要激素之一，GA3-氧化酶是赤霉素生物合成后期的关键酶。为探究GA3-氧化酶编码基因对香蕉矮化的分子调控机理，该文以威廉斯B6 矮化突变体及其野生型亲本为试验材料，通过RT-PCR 技术克隆得到矮化香蕉及其野生型亲本GA3ox 基因的全长cDNA 序列，并对其推测的氨基酸序列进行了比对分析，同时利用荧光定量PCR 技术对GA3ox 基因在不同组织中的表达水平差异进行分析。结果表明：（1）矮化香蕉GA3ox-A 和野生型香蕉GA3ox-G 的ORF 长度均为864 bp，其推测的编码产物的氨基酸序列为287 aa，经序列比对分析发现两条氨基酸序列之间存在5 个位点的差异，从而产生了具有不同性质的蛋白质。（2）氨基酸序列同源性分析表明矮化香蕉GA3ox 的氨基酸序列与油棕、海枣、椰子的同源性最高。（3）qRT-PCR 显示GA3ox 基因在矮化香蕉叶片和茎秆中的表达水平整体上低于野生型，其中，GA3ox 在野生型茎秆中的表达水平是矮化植株的2.2~32 倍。综上推测，GA3ox 基因可能对香蕉茎杆的矮化变异具有重要的调控作用。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-12-19 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 类钙调磷酸酶 B 亚基蛋白（calcineurin B-like calcium sensor，CBL）属 Ca2+结合蛋白，通过与类钙调磷酸酶 B 亚基互作蛋白激酶（calcineurin B-like calcium sensor interacting protein kinase，CIPK）互作介导 Ca2+信号转导过程。CBL-CIPK 信号系统参与了植物对多种逆境胁迫的响应过程。为深入探讨小桐子抗冷性的机制，该研究基于序列比对的方法，在全基因组水平对小桐子 CBL 与 CIPK 基因家族进行鉴定，并对其系统进化、基因结构、表达特性及功能互作进行了解析。结果表明：（1）在小桐子基因组中共鉴定到8 个 CBL 基因与 18 个 CIPK 基因，CBL 与 CIPK 蛋白长度分别在 211~257 aa 与 422~484 aa 之间，等电点分别在 4.65~5.08 与 6.20~9.26 之间。（2）另外，CBL 基因家族都包含 8~10 个外显子，而 CIPK 基因家族分为显著的 1~2 个外显子（11 个基因）与 12~15 个外显子（7 个基因）两类。（3）多序列比对显示，小桐子 CBL 蛋白都鉴定到 1 个由 14 个氨基酸残基组成的非典型 EF-hand 基序与 3 个取代程度不同的典型EF-hand 基序，而 CIPK 蛋白都包含 N 端激酶结构域与 C 端自抑制 FISL/NAF 结构域。（4）染色体定位显示，26 个小桐子 CBL 与 CIPK 基因不均匀地分布于 9 条染色体上。（5）转录组数据分析表明，大部分 CBL与 CIPK 基因在小桐子叶片、根及种子中都有高水平表达，其中，JcCIPK14 与 JcCIPK18 在低温处理时上调表达量达到了极显著水平（P<0.01），参与小桐子的抗冷性过程。以上结果为开展小桐子 CBL 与 CIPK基因的功能鉴定与低温信号转导机制研究提供了借鉴。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-08-09 合作期刊: 《广西植物》
摘要： UDP-类黄酮 3-O-葡萄糖基转移酶(3GT)是花青素生物合成途径的重要催化酶之一。为研究其在紫玉兰花青素苷合成途径中的作用，该文以紫玉兰品种‘红元宝’(Magnolia liliflora ‘Hongyuanbao’)为材料，根据转录组测序获得的 3GT 序列设计引物，利用 RT-PCR技术克隆花青素苷生物合成途径中的结构基因 Ml3GT1，并对其进行生物信息学和表达模式分析。结果表明：（1）Ml3GT1 基因的 cDNA 序列长度为 1 863 bp，其中最长开放阅读框(ORF)为 1 374 bp，编码一条 457 aa 的肽链，相对分子质量为 49.37 kDa，理论等电点(pI)为 6.04。（2）氨基酸序列比对显示其具备典型的植物次生产物糖基转移酶信号序列(PSPG box)。（3）系统发育分析结果表明，Ml3GT1 蛋白与小苍兰、矮牵牛、番薯等物种的 3GT 蛋白聚在一支。（4）qRT-PCR 结果显示 Ml3GT1 基因的表达具有时空特异性，在花中的表达量最高，在嫩叶和老叶中有少量表达，而在根和茎中几乎不表达；且随着花的发育，Ml3GT1 基因的表达量呈现先降低后升高的趋势，并在盛花期达到最高。上述结果表明，Ml3GT1 可能参与类黄酮 3-O 的糖基化修饰，本研究结果将为木兰属植物花色育种研究奠定基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-07-20 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 苯丙氨酸解氢酶（Phenylalanine ammonia-lyase，PAL）基因家族参与苯丙烷类代谢过程，通过调控植物抗病次生物质的合成在植物抗逆反应中发挥重要作用。为明确谷子 PAL 基因家族在逆境胁迫下的表达规律，该文利用生物信息学方法对谷子 PAL 基因家族进行鉴定和表达分析。结果表明：谷子具有 11 个PAL 基因，在进化树中可分为 3 个亚家族，SiPAL7 独自进化为一支。通过构建蛋白结构域发现 PAL 基因家族成员均含有保守的 PAL 结构域。启动子分析显示，PAL 基因含有应答激素、逆境胁迫等多种因子的顺式作用元件，说明 PAL 基因广泛参与不同生物学调控过程。qRT-PCR 结果显示，谷子 PAL 家族基因多为诱导型表达，不同光照条件下 PAL 基因表达量变化明显，不同基因具有不同响应模式，说明谷子 PAL 基因家族在参与光调节反应中发挥重要作用。谷子 PAL 基因高度保守，广泛响应不同非生物胁迫，具有表达特异性。该研究结果可为揭示 PAL 基因家族在调节谷子抗性及胁迫应答过程中的作用提供参考。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-08-02 合作期刊: 《广西植物》
摘要： SKP1 基因是SCF E3 泛素连接酶蛋白复合物的核心成分，参与多种生物过程。然而，香石竹SKP1 基因还未被克隆，该文利用RT-PCR 结合RACE 技术，从香石竹（Dianthus caryophyllus）的花药中分离克隆了1 个减数分裂相关基因SKP1 的全长cDNA 序列，命名为DcSKP1（GenBank 登录号为MK931293）。结果表明：DcSKP1 基因cDNA 全长序列为962 bp，含有1 个长度为567 bp 的ORF，该基因编码188 个氨基酸；蛋白序列比对显示，DcSKP1 中存在一个高度保守TPEE 基序，还具有Skp1_POZ 结构域和Skp1 结构域，并与拟南芥的SKP1 聚集在一个分支上；利用荧光定量PCR 对香石竹DcSKP1 基因表达模式进行研究，发现DcSKP1 基因在各个组织部位都有表达，在花药中的表达量高于茎叶组织，且在幼小的花药中表达量最高，随着花药发育的进程表达量下降。研究推测，DcSKP1 基因可能在香石竹减数分裂中起重要作用。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-05-28 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF) 是植物中重要的逆境调控因子。许多研究表明HSF通过对信号通路下游的逆境相关基因进行调控来提高植物适应逆境的能力，如提高植株在干旱和氧化损伤等逆境中的耐受能力。为研究HSF在木薯抗逆和采后储存中的功能，本研究以木薯品种SC124为材料，通过RT-PCR技术从木薯叶片克隆得到一个木薯HSF家族基因，将其命名为MeHSF10。结果表明：（1）该基因全长为1 098 bp，编码365个氨基酸残基，蛋白质相对分子量为40.7 kD，理论等电点为8.15，蛋白的亚细胞定位预测为细胞核。蛋白质序列分析结果表明MeHSF10与麻风树JcHSF和橡胶树HbHSF的相似性最高，分别为80.31 %和90.54 %。MeHSF10基因的蛋白序列含有HSF蛋白家族的保守结构域，如DBD、HR-A Core、HR-B Core、插入序列和核定位信号 (nuclear localization signal, NLS)，表明MeHSF10基因编码的蛋白质属于HSFC家族成员。（2）为分析MeHSF10基因在木薯不同组织中的表达情况，对该基因在木薯11个组织中的表达进行分析，结果表明MeHSF10基因在木薯所有组织中都有表达，在叶片中的表达最高。（3）对MeHSF10基因的启动子序列进行元件分析，结果显示其含有ABA响应（ABA responsive motif）、干旱诱导 (drought-induced motif) 和光响应 (light-responsive motifs) 等元件。（4）表达分析结果也表明MeHSF10基因能被干旱和ABA处理显著诱导，MeHSF10基因在木薯块茎的采后生理性变质过程中也被显著诱导表达。综上结果表明，MeHSF10基因可能在转录水平参与ABA介导的木薯干旱胁迫响应和木薯块茎的采后生理性变质，这为进一步研究其在木薯抗逆和采后储存中的功能奠定基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-04-03 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 龙胆苦苷（gentiopicroside）是中药龙胆中的主要药效成分，属于萜类化合物的衍生物。1- 羟基-2- 甲基-2- （ E ） - 丁烯基-4- 二磷酸还原酶（ 1-hydroxy-2-methyl-2-butenyl-4-diphosphate reductase），HDR 是萜类物质合成途径中的关键酶。为探讨不同光照条件下滇龙胆HDR（GrHDR）基因的表达与龙胆苦苷含量之间的关系，以滇龙胆叶片cDNA 为模板，采用PCR 和TA 克隆技术获得GrHDR 基因序列，对该序列进行生物信息学分析和表达分析，并采用高效液相色谱法测定龙胆苦苷含量，对该基因表达与龙胆苦苷含量进行比较。结果表明：GrHDR 基因（GenBank 登录号： KJ917165.1）全长1 398 bp，编码465 个氨基酸，推定GrHDR 蛋白是亲水且稳定的，相对分子质量是52 281.25 Da，理论等电点是5.32；该蛋白属于LYTB 蛋白家族，可能定位于叶绿体上，无信号肽，二级结构主要由α-螺旋（45.16%），β-转角（6.24%）、无规卷曲（33.98%）、延伸链（14.62%）构成；GrHDR 蛋白序列与同属植物秦艽的HDR 蛋白相似性最高（95.71%）；实时荧光定量PCR 结果显示GrHDR 基因在滇龙胆中的表达量为：根> 叶> 茎，而在10%、30%、100%全光光照条件下各组织的表达量有很大差异；高效液相色谱法结果显示，不同光照条件下龙胆苦苷含量一致，均为：根> 叶> 茎，其中100%全光光照下，药用部位根中龙胆苦苷含量达到7.141%，约是30%、10%全光光照条件的两倍，但该结果与同一光照条件下GrHDR 基因表达规律不完全一致。本研究为阐述HDR 基因功能及其与龙胆苦苷含量的关系提供参考。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-01-12 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 酸性转化酶作为蔗糖代谢中的关键酶，在还原糖积累型荔枝中表达及酶活性显著高于蔗糖积累型荔枝。为了全面了解酸性转化酶的生物学特征，本研究通过运用生物信息学方法对荔枝果实酸性转化酶LcSAI 基本的理化性质、蛋白二级结构、亲水性/疏水性、跨膜结构域、信号肽、磷酸化位点、保守结构域、系统进化进行系统的分析；利用qRT-PCR 技术对LcSAI 在妃子笑不同组织和果实不同发育阶段进行表达分析。结果表明：荔枝果实酸性转化酶为定位于液泡的亲水性不稳定蛋白，无信号肽，其蛋白的二级结构主要有无规则卷曲和延伸链构件，并散布于整个蛋白；在N-端含有一个跨膜区，包含两个保守结构域，位于N-端的Pfam DUF3357 结构域和Glyco_32 结构域，属于糖基水解酶基因家族32超家族；系统进化表明与龙眼酸性转化酶基因同源，不同组织间LcSAI 表达水平为雄花>根>嫩茎>种子>嫩叶>雌花>果皮>老叶，果实不同发育阶段LcSAI 表达具有特异性。本研究为深入研究LcSAI 果实酸性转化酶基因调控蔗糖代谢途径机理提供数据依据。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2019-08-27 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 该研究从NCBI网站下载油棕全基因组序列信息，从Arabidopsis Information Resource（TAIR）数据库中下载得到拟南芥WRKY转录因子序列，并在油棕基因组数据库中进行BLAST同源序列比对分析，通过NCBI在线工具CDD和PFAM数据库进行蛋白结构与分析，剔除无WRKY结构域的系列，利用生物信息学方法对油棕WRKY转录因子进行分析及功能预测。结果表明：从油棕基因组数据库中发掘WRKY转录因子95个，该WRKY转录因子蛋白质所编码氨基酸大小为116～1 303 bp，95个均为亲水性蛋白，总体为不稳定蛋白（EgWRKY25和EgWRKY56除外），60个蛋白以α-螺旋为主要二级结构元件，35个以无规卷曲为主要二级结构元件。保守结构域系统进化树结果表明，油棕WRKY转录因子家族蛋白主要分为三大类（I、II和III），I类分为IC和IN亚类，II类分为II a、II b、II c和II d亚类。内含子和外显子结构结果表明，EgWRKY基因结构进化高度保守。该研究结果对油棕WRKY转录因子的挖掘、功能分析及分子生物学研究奠定了基础，此外，还对分子育种和遗传改良提供参考。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2019-08-27 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为探究夏枯草中GGPPS基因的生物学特性及功能，本实验在夏枯草转录组测序的基础上设计特异性引物，采用逆转录 PCR 技术获得夏枯草中GGPPS基因的全长核苷酸序列，并进行生物信息学分析；采用 qPCR 法分析PvGGPPS基因在不同外源性物质诱导下在夏枯草果穗中的表达量以及该基因在夏枯草不同组织中的表达量。结果表明：PvGGPPS 基因开放阅读框1 092 bp，编码363个氨基酸，理论分子量为38 815.68 D，等电点为5.69。PvGGPPS蛋白具有异戊烯基焦磷酸合酶家族的特征结构域。系统进化树表明PvGGPPS蛋白与丹参、毛喉鞘蕊花GGPPS蛋白具有较高的亲缘关系。qPCR分析表明，PvGGPPS基因在叶中表达量高于果穗及茎。对果穗施加7种外源性物质处理24 h后，GA3 处理组该基因表达量升高。PvGGPPS 基因在夏枯草不同组织中表达量差异较大，且受外源物质诱导表达。该研究结果为进一步研究PvGGPPS 基因对夏枯草萜类成分合成途径中的功能及表达调控奠定基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2019-02-25 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 在夏枯草转录组测序的基础上设计特异引物，采用逆转录PCR技术获得该基因的全长核苷酸序列，并进行生物信息学分析，采用qRT-PCR法分析PvDXS在夏枯草不同组织及不同外源性物质诱导下的表达量。克隆得到的PvDXS基因开放阅读框2181 bp，编码726个氨基酸，理论分子量为78 040.47 D，等电点为6.75,PvDXS 蛋白具有Transketolase_C 结构域和Transket_pyr 结构域，系统进化树结果表明，PvDXS 蛋白与丹参、长春花的DXS（SmDXS2、CrDXS2）亲缘关系较近，推测PvDXS 属于第II 类DXS 蛋白。qRT-PCR 分析表明，PvDXS 基因在叶中表达量高于果穗及茎。对果穗施加7种外源性物质处理24 h后，GA3处理组该基因表达量升高，其它6种外源性物质处理后表达量均降低，其中CaCl2、SNP、SA处理后该基因的表达量显著降低。PvDXS基因在不同组织中表达量差异较大，且受外源物质诱导表达，该研究结果为进一步研究PvDXR基因对夏枯草萜类成分合成途径中的功能及表达调控奠定基础
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