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一种新型冠状病毒药物与天然产物快速发现的计算药理学方法

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aCODE: Agile Discovery of Drugs and Natural Products for Emerging Epidemic 2019-ncov based on Computational Pharmacology

摘要: 新发传染病爆发流行期间,亟需提出候选药物功效、机制、毒副作用的可供验证的科学假说。疫苗或新药研发均需要一定时间,因而药物重定位(老药新用)策略有其用武之地。但是新发疾病其病原体、宿主反应的临床数据不充分制约了候选药物假设的提出。此阶段常根据病人临床特征进行广谱抗病毒药物的尝试。本文借鉴人工智能领域常见的启发式搜索思路,提出一种新方法(aCODE),基于前期有一定疗效提示的广谱抗病毒药,获得其宿主靶蛋白集合,在全基因组尺度上搜索与之相关性最高的基因模块组合,进而对候选化合物(如已批准上市药物、天然产物)进行模式匹配与统计检验排序。本方法可根据临床实践的进展更新输入药物,迭代输出更精准结果,输出的天然产物或中药、药食同源成分结合其它信息后可实施快速测试,形成敏捷研发测试闭环;并为爆发期医疗资源极其有限情况下大量人群的居家预防与方案测试提供科学支持。

版本历史

[V2] 2020-02-21 16:52:10 ChinaXiv:202002.00009v2 查看此版本 下载全文
[V1] 2020-02-04 21:49:36 ChinaXiv:202002.00009V1 下载全文
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