Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany submitted time 2021-04-13 Cooperative journals: 《广西植物》
Abstract： The pan-genome can represent all of the genetic diversities in a species or population, which is a limitation for obtaining only one single reference genome. The pan-genomics is becoming a new hot research area and being widely applicated in researches of many species in plants, animals and microorganisms, as the development of the whole genome sequencing and analysis technology. It provided powerful tools for resolving the genetic variation and polymorphism at levels of species or taxa, researches of functional genomics and reconstruction of phylogenetics, obtaining abundant of significant research achievements. However, present researches on pan-genomics still need improve due to several problems, e.g., extensive cost of whole genome sequencing and data analysis, inconsistent analysis standards, lack of deeper and comprehensive explanation of the obtained data, and difficulty of application of the research achievements. We summarized the research progresses of pan-genomes on exploitation of genetic diversity and functional genomics, including construction of a pan genome map, identification of genome variations and favorable genes, polymorphism of functional genes, population genetic diversity and systematic evolution, and discussed its potential in application of different research fields. Furthermore, we discussed the limitations existed in the present studies and possible solutions, and directed the development prospect in the future on pan-genomics.
Subjects: Biology >> Zoology submitted time 2018-12-25 Cooperative journals: 《动物营养学报》
Abstract：本研究以磷酸氢钙（DCP）为参照物，以断奶仔猪生长性能、饲粮消化率、血清和骨骼指标为对象，评价饲用高水溶性磷酸一二钙（MDCP）的相对生物学利用率。试验采用2×5因子随机试验设计，选择432头4~5周龄、体重相近的杜×长×大杂交断奶仔猪为试验动物，随机分为9组，每组6个重复，每个重复8头猪。每种矿物盐设5个磷添加水平，分别为0、0.05%、0.10%、0.15%、0.20%，共9个处理（0添加组共用）。试验预试期3 d，正试期35 d。结果表明：1）仔猪平均日采食量、平均日增重及死亡率等指标在磷源和磷添加水平之间均不存在显著交互作用（P﹥0.05）。试验第15～35天，MDCP组仔猪平均日采食量显著高于DCP组（P﹤0.05）；试验第15～35天和第1～35天，随着饲粮磷水平的提高，仔猪的平均日增重和平均采食量均显著增加（P0.05）。2）不同磷酸盐和磷添加水平之间对仔猪饲粮干物质、钙和磷的表观消化率均无显著交互作用（P﹥0.05）。MDCP组饲粮钙和磷的表观消化率均显著高于DCP组（P﹤0.05）；0.10%、0.15%和0.20%无机磷添加组钙的表观消化率显著高于0添加组（P﹤0.05）。以磷酸盐中磷的表观消化率、真消化率为指标建立回归方程，根据斜率比计算MDCP相对于DCP的生物学利用率均为120%。3）试验第14天和第35天时，不同磷源和磷添加水平对仔猪血清碱性磷酸酶（ALP）活性均无显著影响（P﹥0.05），也无显著交互作用（P﹥0.05）。试验第14天时，血清磷、钙和甲状旁腺素（PTH）含量在不同磷源和磷添加水平之间存在显著交互作用（P﹤0.05），但试验第35天时不存在显著交互作用（P﹤0.05）。试验第14天时，MDCP组血清钙含量显著高于DCP组（P﹤0.05），MDCP组血清降钙素（CT）含量显著低于DCP组（P﹤0.05）。试验第14天和第35天时血清CT含量在不同磷酸盐和不同磷添加水平之间无显著交互作用（P﹥0.05）。血清钙、磷和PTH含量与磷添加水平之间存在显著的线性回归关系（P<0.05）。以血清钙、磷和PTH含量为指标建立回归方程，根据回归方程斜率比计算的MDCP的相对生物学利用率为96%、102%和115%，平均值为104%。4）不同磷酸盐和不同无机磷添加水平对仔猪股骨、胫骨和掌骨的骨骼断裂强度均无显著影响（P﹥0.05），也无显著交互作用（P﹥0.05）。股骨灰分与磷添加水平之间存在显著的线性回归关系（P<0.05）。以股骨灰分含量为指标，根据回归方程斜率比计算的MDCP的相对生物学利用率为255%。综上所述，以试剂级DCP的生物学利用率为100%，以磷酸盐中磷的表观消化率和真消化率为指标，MDCP的相对生物学利用率均为120%；以血清指标和股骨灰分含量为指标，MDCP的相对生物学利用率分别为104%和255%。
Subjects: Biology >> Zoology submitted time 2018-12-24 Cooperative journals: 《动物营养学报》
Abstract：发育良好的瘤胃对于幼龄反刍动物至关重要，不仅关乎其自身的健康，也与其成年后生产性能的发挥息息相关。对于刚出生的幼龄反刍动物，其瘤胃不具有生酮功能，随日龄的增加，瘤胃形态与功能逐渐发育成熟，逐渐具备了该功能。生酮作用是瘤胃发育成熟的关键因素，β-羟丁酸（BHBA）被认为是瘤胃发育成熟的标志。近十几年来，许多学者针对影响瘤胃生酮作用的因素进行了大量研究，发现过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）对于瘤胃生酮和上皮细胞增殖十分重要，转录因子PPARs可以影响到生酮作用关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合成酶2（HMGCS2）的表达。但目前对于PPARs调控瘤胃生酮作用分子机制的了解仍然十分有限，因此本文针对PPARs调控幼龄反刍动物瘤胃发育的研究进展进行了综述。
Subjects: Biology >> Zoology submitted time 2018-12-24 Cooperative journals: 《动物营养学报》
Abstract：发育良好的瘤胃对于幼龄反刍动物至关重要，不仅关乎其自身的健康，也与其成年后生产性能的发挥息息相关。对于刚出生的幼龄反刍动物，其瘤胃不具有生酮功能，随日龄的增加，瘤胃形态与功能逐渐发育成熟，逐渐具备了该功能。生酮作用是瘤胃发育成熟的关键因素，β-羟丁酸（BHBA）被认为是瘤胃发育成熟的标志。近十几年来，许多学者针对影响瘤胃生酮作用的因素进行了大量研究，发现过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）对于瘤胃生酮和上皮细胞增殖十分重要，转录因子PPARs可以影响到生酮作用关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合成酶2（HMGCS2）的表达。但目前对于PPARs调控瘤胃生酮作用分子机制的了解仍然十分有限，因此本文针对PPARs调控幼龄反刍动物瘤胃发育的研究进展进行了综述。
Subjects: Biology >> Zoology submitted time 2017-10-23 Cooperative journals: 《动物营养学报》
Abstract：本试验旨在研究蛋氨酸水平对羔羊体况发育、消化道组织形态及血清抗氧化指标的影响。试验选取12对7日龄断母乳的湖羊双胞胎公羔，采用配对试验设计，分为对照（CON）组和低蛋氨酸（LM）组，1对双胞胎羔羊分别分到2个组中。试验分2个阶段进行，第1阶段（8～56日龄），CON组羔羊饲喂基础代乳粉和基础开食料；LM组羔羊饲喂的代乳粉和开食料在CON组基础上分别全部扣除（0.70%和0.40%）额外添加的蛋氨酸，其余营养水平保持一致。第2阶段（57～84日龄），2组羔羊停止饲喂代乳粉且饲粮均为基础开食料。在56和84日龄，各选取6对双胞胎羔羊进行屠宰，分离消化道组织，采集血清样品。结果表明：1）在采食量方面，LM组羔羊对蛋氨酸采食量在8~56日龄、8~84日龄阶段均极显著低于CON组（P0.05）；84日龄，2组间体况发育指标均无显著性差异（P>0.05）。2）56日龄，LM组羔羊的瘤胃乳头宽度显著低于CON组（P0.05）。3）56日龄，LM组羔羊血清中超氧化物歧化酶活性极显著低于CON组（P0.05）。结果提示，饲粮低蛋氨酸水平抑制了羔羊体况发育（体重、体斜长、胸围、体长指数）及瘤胃乳头宽度的增加，同时降低了机体血清中超氧化物歧化酶活性，然而却提高了干物质采食量；提高饲粮蛋氨酸水平后，羔羊体况发育及消化道组织形态发育也随之得到补偿，但机体抗氧化防御系统仍未得到完全改善。
Subjects: Biology >> Zoology submitted time 2017-10-11 Cooperative journals: 《动物营养学报》
Abstract：本试验旨在研究牧区冬春季低质粗饲料供给下，补饲不同钙、磷水平的精料补充料对断奶羔羊生长性能、血清指标及骨成分的影响。选取（30±2）日龄、体重为（12.50±1.21） kg断奶乌珠穆沁羔羊96只，随机分成3组，每组32只，公母各占1/2，3组羔羊分别补饲相同钙磷比、不同钙、磷水平的3种精料补充料，分别为A组（钙0.40%、磷0.38%）、B组（钙0.50%、磷0.48%）和C组（钙0.68%、磷0.65%），试验期55 d，其中预试期5 d，正试期50 d。结果表明：随着精料补充料钙、磷水平的增加，羔羊总采食量、平均日增重没有显著变化（P>0.05），平均日增重接近200 g/d；试验第50天，各组羔羊血清钙、甲状旁腺素含量及碱性磷酸酶活性也无显著性差异（P>0.05），C组羔羊血清磷含量显著高于A组和B组（P˂0.05）；C组羔羊胫骨钙含量显著高于A组（P˂0.05），与B组差异不显著（P>0.05），各组羔羊胫骨磷含量无显著差异（P>0.05）。由此可见，在牧区冬春季枯草期，不同钙、磷水平的精料补充料未对乌珠穆沁羔羊的生长性能、部分血清指标及胫骨磷含量产生显著影响，精料补充料中钙0.40%、磷0.38%的水平即可满足羔羊生长需求，加入过量的钙、磷，既浪费资源又污染环境。
Subjects: Biology >> Zoology submitted time 2017-10-10 Cooperative journals: 《动物营养学报》
Abstract：本试验旨在研究饲粮能量和蛋白质水平对61~120日龄断奶湖羊羔羊生长性能、氮代谢及血清生化指标的影响。采用2×2两因素两水平试验设计，选取64只61日龄体重相近的纯种湖羊羔羊，随机分为4组，饲喂不同能量和蛋白质水平的饲粮，分别为高能量[代谢能（ME）为10.92 MJ/kg]高蛋白质[粗蛋白质（CP）为15.74%]组、高能量（ME为10.92 MJ/kg）低蛋白质(CP为11.78%）组、低能量（ME为8.64 MJ/kg）高蛋白质(CP为15.72%）组、低能量（ME为8.64 MJ/kg）低蛋白质(CP为11.82%）组，每组4个重复，每个重复4只，公母各占1/2。试验期60 d。结果表明：1)饲粮能量与蛋白质水平对羔羊生长性能指标不存在交互作用（P>0.05）；饲粮高能量高蛋白质水平显著提高了羔羊61~90日龄的平均日增重（P<0.05），显著降低了料重比（P<0.05）。2)饲粮高蛋白质水平显著提高了81~90日龄、111~120日龄羔羊氮摄入量（P<0.05）；饲粮低能量高蛋白质水平显著提高了81~90日龄、111~120日龄羔羊尿氮排出量（P<0.05），并且以低能量高蛋白质组尿氮排出量最高；对于81~90日龄羔羊，饲粮高能量高蛋白质水平显著提高了氮沉积（P<0.05），而饲粮低能量或高蛋白质水平显著降低了氮生物学效价（P<0.05）。3）羔羊120日龄时，饲粮低能量水平显著降低了血清葡萄糖含量（P<0.05），显著提高了血清尿素氮含量（P<0.05）；饲粮低蛋白质水平显著提高了血清胰岛素样生长因子Ⅰ含量（P<0.05）。综上所述，61~90日龄阶段，饲粮高能量高蛋白质水平可促进羔羊生长；91~120日龄阶段，可适当降低饲粮蛋白质水平以节约生产成本，不会对生长性能产生不利影响。
Subjects: Biology >> Zoology submitted time 2017-10-10 Cooperative journals: 《动物营养学报》
Abstract：本试验旨在研究复合益生菌和纤维寡糖对断奶仔猪生长性能、粪便微生物及血清指标的影响。选用120头初始平均体重为（9.72±2.25） kg的断奶仔猪，随机分为4组，每组3个重复，每个重复10头。分别饲喂基础饲粮（对照组)、基础饲粮+0.30%复合益生菌（A组）、基础饲粮+0.08%纤维寡糖（B组）、基础饲粮+0.30%复合益生菌+0.08%纤维寡糖（C组），试验预试期4 d，正试期35 d，正试期分为第1阶段（1～14 d）和第2阶段（15～35 d）2个阶段。结果表明：1）除试验15～35 d时C组试验仔猪料重比(F/G)显著低于对照组（P0.05）；试验1～14 d时A、C组试验仔猪腹泻率(DR)均显著低于对照组（P0.05)。3）各组试验仔猪各项血清指标也均无显著差异(P>0.05)。由此可见，本试验条件下，添加复合益生菌和纤维寡糖可改善断奶仔猪断奶后1～14 d的腹泻情况，提高断奶仔猪断奶后15～35 d的饲料利用效率。
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