• 巨桉叶绿体基因组密码子偏好性分析

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2019-01-30 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 为了提高基因表达效率从而利用叶绿体基因工程改良巨桉重要性状,该文以巨桉叶绿体基因组序列为材料,选取其中长于 300nt 且以 AUG 为起始密码子的 43 个非重复基因为研究对象,采用 CodonW1.4.2 软件分析巨桉叶绿体基因组的密码子使用偏好性。分析结果表明:第 3 位密码子的平均 GC 含量为 27.97%;ENC 的变化范围为 39.49~61.00,平均为 47.04;RSCU>1 的密码子有 31 个,其中 29 个以 A/U 结尾;中性分析显示 GC12 与 GC3 无显著相关,回归分析也未达到显著性水平;ENC-plot 分析发现大部分基因落在曲线上或附近;对应分析表明第一轴的贡献率为 17.68%,第二轴的贡献率为 11.49%,第三、四轴的贡献率分别为 8.00%和 5.76%,前四轴累计贡献率达 42.93%,第一轴与 GC、ENC、CAI 达到极显著相关;上述分析结果表明,巨桉叶绿体基因组的密码子偏好较弱,密码子第 3 位偏好以 A或 U 结尾;选择和突变在巨桉叶绿体基因组密码子偏好中起相对均衡的作用;最终确定UUG、CUU、GUU、UCC、UCA、ACA、UAU、UAA、CAU、AAU、AGA 和 GGA 12 个高频高表达密码子为最优密码子。该研究为转化叶绿体基因密码子优化从而提高表达效率改良巨桉目标性状奠定了坚实基础。

  • 饲料脂肪水平对大鳞副泥鳅幼鱼生长性能、消化酶活性及抗氧化能力的影响

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2017-10-10 合作期刊: 《动物营养学报》

    摘要: 本试验旨在研究饲料脂肪水平对大鳞副泥鳅幼鱼生长性能、消化酶活性及抗氧化能力的影响。选用初始体重(0.15±0.01) g的大鳞副泥鳅幼鱼1 620尾,随机分成6组,每组3个重复,每个重复90尾鱼,分别投喂脂肪水平为2.50%、4.49%、6.48%、8.47%、10.46%和12.45%的试验饲料,养殖时间为60 d。结果表明:大鳞副泥鳅幼鱼的特定生长率(SGR)在饲料脂肪水平为8.47%时最高,为4.99%/d,除与10.46%组差异不显著(P>0.05)外,显著高于其余各试验组(P<0.05);饲料系数(FCR)在饲料脂肪水平为8.47%时最低,为1.09,除与10.46%组差异不显著(P>0.05)外,显著低于其余各试验组(P<0.05)。通过二次多项式回归分析可知,大鳞副泥鳅幼鱼SGR、FCR最优时饲料脂肪水平分别为9.18%、9.00%。随着饲料脂肪水平的升高,大鳞副泥鳅幼鱼肝胰脏及前肠蛋白酶、脂肪酶活性均呈先升高后降低的变化趋势,且均在8.47%组达到最高值,除与10.46%组差异不显著(P>0.05)外,显著高于其余各试验组(P<0.05);肝胰脏和前肠淀粉酶的活性则呈先下降后逐渐趋于稳定的趋势。随着饲料脂肪水平的升高,肝胰脏超氧化物歧化酶、过氧化氢酶活性均呈先升高后降低的变化趋势,且均在8.47%组达到最高值,除与10.46%组差异不显著(P>0.05)外,显著高于其余各试验组(P<0.05)。由此得出,适宜的饲料脂肪水平可促进大鳞副泥鳅幼鱼的生长,提高其蛋白酶与脂肪酶活性和抗氧化能力。本试验条件下,综合考虑大鳞副泥鳅幼鱼生长性能、消化酶活性和抗氧化能力,其饲料的适宜脂肪水平为8.47%~10.46%。