珍稀濒危植物越南小花金花茶的叶绿体基因组特征分析

摘要: 越南小花金花茶(Camellia minima) 是一种珍稀濒危的金花茶组植物，目前尚未有其 叶绿体基因组的相关研究。该研究利用Illumina HiSeq 2000 平台对越南小花金花茶进行了叶 绿体基因组序列的测序、组装、注释和分析。结果表明：(1) 越南小花金花茶叶绿体基因组 全长156 961 bp，为典型的四分体结构，共注释到136 个基因，其中包含87 个蛋白编码 基因，41 个tRNA 基因和8 个rRNA 基因。(2) 分析鉴定出66 个SSR 位点和39 个重复序 列。(3) 密码子偏好使用以A/U 结尾的密码子，综合ENC 绘图、PR2-plot 和中性分析推测 自然选择是影响密码子使用模式的主导因素。(4) 边界分析显示ycf1 基因的长度和位置在不 同金花茶组植物间存在差异。(5) 对已发表的金花茶组植物叶绿体基因组的系统发育分析发 现越南小花金花茶与小花金花茶聚为一支，亲缘关系很近。该研究结果为探索物种进化和 提高外源基因表达提供了重要的参考信息，同时为后续的金花茶组植物的保护和利用提供 了理论基础。