中粒咖啡 WRKY 基因家族的生物信息学分析

摘要: WRKY 转录因子是植物信号网络中不可缺少的部分，作为植物中最大的转录因子家族之一，在植物的多种应激反应中发挥重要作用。利用生物信息学方法对中粒咖啡􀀁WRKY 蛋白家族的理化特性及其分子进化进行了详细的分析。结果表明：CcWRKY 蛋白氨基酸数量在􀀁103~994个之间，均无信号肽，推测其为非分泌性蛋白。其二级结构以无规则卷曲为最主要的结构元件，三级结构主要分为􀀁6 类，其中以􀀁CcWRKY61、CcWRKY72、CcWRKY6 和􀀁CcWRKY7 为主要成员的􀀁D 类结构最稳定。保守结构域及进化树分析表明中粒咖啡􀀁WRKY 基因家族含有􀀁49 个成员，其中的􀀁10 个成员归为􀀁WRKY 第Ⅰ家族，34 个成员归为􀀁WRKY 第Ⅱ家族，5 个成员归为􀀁WRKY 第􀀁Ⅲ家族。中粒咖啡􀀁WRKY1 基因与其他物种的系统进化分析结果表明其􀀁WRKY1 与烟草亲缘关系最近，与非洲油棕(Elaeis guineensis)亲缘关系最远，说明􀀁WRKY1 蛋白在生物进化过程中还是比较保守的。该文研究结果可以为中粒咖啡􀀁WRKY 基因家族的分子功能的深层次研究提供一定的借鉴作用，对进一步探究中粒咖啡􀀁WRKY 基因的功能、进化以及分子育种具有重要的现实意义。