烟草TIR-NBS基因家族的生物信息学分析

作者： 董亚萍 ¹ 杨仕梅 ¹ 赵德刚 ^1,2 宋莉 ¹
作者单位：

1. 贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院，山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室, 贵州省农业生物工程重点实验室，贵阳550025；贵州省农业科学院，贵阳550006
提交时间：2020-03-24 10:21:14

摘要: TIR-NBS基因是一类与植物抗病调节和生长发育密切相关的基因，其特征解析有助于对植物免疫和发育调节的认识。通过生物信息学分析方法，从基因鉴定、染色体分布、基因结构、蛋白性质和结构、信号肽、亚细胞定位和顺式作用元件等方面，对烟草TIR-NBS基因家族进行鉴定和分子特性分析。研究发现，烟草TIR-NBS基因家族含有30条成员，分布在21条染色体上，含有3~8个保守基序；编码蛋白均为不稳定蛋白，无信号肽，主要分布于细胞核、细胞质和叶绿体中，二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要构成元件；进化时主要受纯化选择作用，与番茄的TIR-NBS基因亲缘关系最近；顺式作用元件分析表明其可能受光照、温度以及生长素、茉莉酸甲酯、脱落酸、水杨酸、赤霉素等激素调控。研究结果为进一步探究TIR-NBS基因的生物学功能及提高植物产量和品质提供了依据。

烟草抗病调节生长发育植物免疫 TIR-NBS基因家族生物信息学分析

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学
引用： ChinaXiv:202003.00063 (或此版本 ChinaXiv:202003.00063V1)
DOI:10.12074/202003.00063V1
CSTR:32003.36.ChinaXiv.202003.00063.V1
推荐引用方式： 董亚萍,杨仕梅,赵德刚,宋莉.(2020).烟草TIR-NBS基因家族的生物信息学分析.广西植物.[ChinaXiv:202003.00063] (点此复制)

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2020-03-24 10:21:14

ChinaXiv:202003.00063V1

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