探讨植物单染色体测序中的假阳性问题

作者： 王发明 ¹ 莫权辉 ¹ 叶开玉 ¹ 龚弘娟 ¹ 刘平平 ¹ 蒋桥生 ¹ 齐贝贝 ¹ 李洁维 ¹
作者单位：

1. 广西植物功能物质研究与利用重点实验室，广西壮族自治区，广西植物研究所，广西桂林 541006
提交时间：2019-08-26 11:13:41

摘要: 单细胞测序技术目前广泛应用于人类、动物、微生物等物种的研究上，但在植物界，因为细胞壁的存在，使得单细胞测序技术在植物上的应用举步维艰。如果能分离出植物单条染色体，然后应用单细胞测序技术进行扩增和测序，可以避免细胞壁的干扰，具有重要的应用价值。科研人员一直尝试针对单条植物染色体进行测序，但目前还未见成功的报道，也未见有文章对失败的原因进行讨论。本研究以六倍体中国春小麦为材料，针对使用单细胞测序技术进行单染色体扩增过程中出现的假阳性问题进行了研究和探讨，分析了单染色体扩增失败的主要原因。并通过高通量测序技术对外源污染的可能来源进行了研究，表明在对实验器具、耗材、环境污染严格防控的基础上，人体接触可能是造成污染的主要来源。同时推测单染色体扩增失败可能是因为染色体自身超螺旋状态造成引物难以结合和复制，并针对存在的问题提出了可行性建议。本研究为将来成功进行单染色体测序提供了有益的借鉴。

单染色体单细胞测序外源污染假阳性 MDA MALBAC

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学
引用： ChinaXiv:201908.00104 (或此版本 ChinaXiv:201908.00104V1)
DOI:10.12074/201908.00104V1
CSTR:32003.36.ChinaXiv.201908.00104.V1
推荐引用方式： 王发明, 莫权辉, 叶开玉, 龚弘娟, 刘平平, 蒋桥生, 齐贝贝, 李洁维.(2019).探讨植物单染色体测序中的假阳性问题.广西植物.[ChinaXiv:201908.00104] (点此复制)

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2019-08-26 11:13:41

ChinaXiv:201908.00104V1

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