菠萝蜜WRKY 基因家族注释及在低温胁迫下的表达模式分析
后印本
Identification and expression pattern analysis of WRKY gene family in jackfruit under low temperature stress
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作者：
马湘玮
1,2
朱鹏锦
1,2*
杜英俊
1,2
宋奇琦
1,2
叶维雁
1,2
唐秀观
1,2
何江
1,2
钟云婕
1,2
欧景莉
1,2
庞新华
1,2
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作者单位：
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提交时间：2024-10-25 17:03:03
摘要: WRKY 转录因子家族在植物生物和非生物胁迫响应过程中发挥着重要作用，该研究
基于菠萝蜜全基因组，共注释出61 个菠萝蜜（Artocarpus heterophyllus）WRKY 家族成员，
并利用生物信息学方法和实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术分析WRKY 家族成员在不同
品种菠萝蜜低温胁迫下的表达特征。结果表明：（1）进化树分析表明菠萝蜜、拟南芥
（Arabidopsis thaliana）和水稻（Oryza sativa）WRKY 家族成员被分为4 个亚族。（2）染色
体定位结果显示，61 个菠萝蜜WRKY 家族成员不均匀的分布在23 条染色体上。（3）保守
基序和基因结构分析表明，位于同一亚族的菠萝蜜WRKY 家族成员具有相似的保守基序和
基因结构。（4）进化分析显示，菠萝蜜WRKY 家族成员在物种内存在124 对片段复制基因
对，物种间分析表明，菠萝蜜与拟南芥之间的同源基因对较多，而与水稻和无花果（Ficus
carica）之间的同源基因对较少且有8 个基因在3 个物种中形成同源基因对。（5）低温胁迫
下不同品种菠萝蜜转录组分析结果表明，菠萝蜜WRKY 家族成员在不同品种中的表达模式
存在差异，qRT-PCR 分析进一步验证这一结果，说明WRKY 家族成员在不同品种菠萝蜜响
应低温胁迫的过程中发挥功能。该研究为了解WRKY 家族成员的进化和功能提供了新的见
解，为菠萝蜜WRKY 家族成员的功能研究和利用奠定了基础。
版本历史
| [V1] |
2024-10-25 17:03:03 |
ChinaXiv:202411.00079V1
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