蛇足石杉COBRA 基因家族的分子生物信息学及表达分析
Molecular bioinformatics and expression analysis of the COBRA gene family in Huperzia serrata
摘要: 弄清蛇足石杉COBRA 基因家族成员分子生物信息学特征及组织表达规律,为
COBRA 基因进一步研究提供依据。基于蛇足石杉的全长转录组数据,通过生物信息学技术
对该家族成员(HsCOBRAs)的理化性质、结构域、保守基序、顺式作用元件、基因表达量
等进行分析。结果表明:(1)在蛇足石杉全长转录组中共筛选出24 个HsCOBRAs 家族成
员,其中酸性蛋白9 个,稳定蛋白11 个,疏水性蛋白5 个,具有跨膜结构的蛋白7 个,具
有信号肽的蛋白3 个。(2)亚细胞定位在细胞壁、叶绿体、细胞核、细胞膜上。(3)结构
分析发现HsCOBRAs 有7 种结构域和6 种保守基序,部分成员具有高度保守的CCVS 结构。
(4)HsCOBRAs 具有CAAT-box、TATA-box 等46 种顺式作用元件。(5)HsCOBRA2 在叶、
孢子、茎、芽胞中的表达量均最高。蛇足石杉COBRA 基因家族分子生物信息学及表达特征
可为HsCOBRAs 的进一步研究及生物学功能验证等提供理论依据。
版本历史
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2023-12-24 22:04:07 |
ChinaXiv:202312.00291V1
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