分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-04-29 合作期刊: 《广西植物》
摘要： GeBP 转录因子调控植物表皮毛的生长发育，并且参与控制植物叶片的发育。利用生 物信息学方法，在大豆全基因组范围内搜索 GeBP 基因家族，并从氨基酸理化性质、基因结 构、染色体的物理分布、系统进化、序列比对、功能结构域、组织表达情况等基本特征方面 对 GmGeBP 基因家族进行分析。共获得 9 个 GmGeBP 转录因子家族基因成员，其中仅 2 个 基因含有内含子，而且都只有 1 个内含子，表明该家族成员基因构造比较简单但稳定。 GmGeBP 编码的蛋白分子量为 39.65～49.24 kD，理论等电点为 4.65～9.08；这些成员基本上 都是酸性氨基酸，属于亲水性、不稳定蛋白。这 9 个基因不均匀的分布于 7 条染色体上，10 和 20 号染色体上分别分布 2 个 GeBP 基因，3、5、13、15、19 号染色体上各分布 1 个 基因。系统进化分析表明，大豆与拟南芥对应的 GeBP 成员亲缘关系较近，分别聚类到 4 个 分支，而与水稻的距离较远。结构域分析表明，9 个 GmGeBP 成员都包含 DUF573 结构域， 推测该部分在 GeBP 转录因子中很可能是与靶标基因顺式作用元件互作的结构域。通过分析 大豆 GmGeBP 转录因子家族基因的组织表达，发现不同基因的在大豆不同组织的表达量不 同，具有一定的特异性。该文对大豆 GeBP 转录因子基因家族的分析和鉴定为进一步研究大 豆表皮毛发育的分子作用提供了理论基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-04-29 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 植物 DUR3 同源蛋白于属于钠离子/溶质共运蛋白家族的尿素高亲和力运输蛋白，在植物 体对外源尿素的主动吸收及内源尿素的再分配过程中发挥重要作用。为明确棉花 DUR3 基因的 结构和进化情况，利用生物信息学的方法，从全基因组水平鉴定陆地棉和雷蒙德氏棉的 DUR3 基因，并对基因结构、跨膜结构域、基序分布、进化关系等进行分析。结果表明，从陆地棉 A 亚组和 D 亚组染色体各鉴定出 1 个 DUR3 基因，从雷蒙德氏棉基因组鉴定出 1 个 DUR3 基因。 这 3 个棉花 DUR3 同源蛋白同其他植物 DUR3 同源蛋白一样，具有 15 个跨膜结构域，具有 3 个 位置一致、高度保守的基序。基因结构分析表明，双子叶植物 DUR3 基因的外显子个数明显多 于单子叶植物，此 3 个棉花 DUR3 基因的外显子个数亦是如此。不同物种 DUR3 氨基酸序列构 建的进化树显示，这些基因根据物种间种属亲缘关系的远近而进行了聚类，棉花的同双子叶植物 的聚在一起。DUR3 直系同源基因和旁系同源基因的 Ka/Ks 比值普遍均大于 1，说明这些基因在 进化过程中主要受到正向选择的作用。本文的研究结果将为深入研究棉花 DUR3 同源蛋白提供 理论基础。
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