分类: 生物学 >> 病毒学 提交时间: 2020-02-25
摘要: Frequent outbreaks of coronavirus make the development of an effective vaccine imperative. Recently, vaccines based on in-vitro transcribed messenger RNA (mRNA) have shown great potential. The streamlined manufacturing of mRNA molecules, combined with the superior flexibility in the antigen screening, greatly accelerates the development process. When using an mRNA platform to develop a vaccine, initial antigen choice plays a crucial role in determining the final efficacy and safety of the vaccine. Furthermore, mRNA sequences that encode antigens require extensive optimization to ensure highly efficient and sustained expression. Our ongoing efforts to develop an effective mRNA vaccine against 2019-nCoV place emphasis on the virus-like particles (VLPs) as the presenting antigen. At the same time, our second fast track uses mRNA to express the receptor-binding domain of the spike protein(S-RBD). After extensive optimization, an mRNA cocktail containing three genes is able to produce 2019-nCoV virus-like particles highly similar to the native 2019-nCoV. Meanwhile, an mRNA vaccine candidate expressing S-RBD is being tested in mice for its immunogenicity. We will next compare both the efficacy and the safety of the two mRNA vaccines based on S-RBD and VLPs, respectively.
分类: 物理学 >> 交叉学科物理及相关领域的科学与技术 分类: 生物学 >> 病毒学 提交时间: 2020-02-25
摘要: 由于春运出湖北省高峰和全国各地管控开始之间的时间差,使得在这个时间段内,除湖北外的国内地区是个输入一代到感染二代之间独立自然连续传播体系。基于此,我们使用正态分布的线性叠加来拟合全国除湖北外每日新增的数据,简单模型预测和实际新增结果的高度吻合验证了除湖北外是个近似理想系统。拟合计算得到的新冠病毒可再生系数R0=2.2,一代到二代的峰值传播时间是7天。我们还讨论了偏离理想传播体系的原因并分析了一些省的特殊情况。
分类: 生物学 >> 病毒学 提交时间: 2020-02-22
摘要: 新型冠状病毒肺炎目前仍在武汉和中国其他地区持续。在目前的形势下,进一步了解新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的病毒学和病毒与宿主的相互作用,对控制感染、开发有效的治疗方法具有重要意义。RNA干扰(RNA interference,RNAi)是一种进化上保守的真核生物抗病毒免疫机制,目前已发现许多病毒编码自身的RNA干扰抑制因子作为对抗措施。在这项研究中,我们发现SARS-CoV-2编码的核衣壳蛋白(N)有效地抑制了shRNAs或siRNAs触发的RNAi。此外,与许多由其他病毒编码的VSR类似,SARS-CoV-2的VSR在体外与人类细胞中与dsRNA相互作用,显示出双链RNA(dsRNA)结合活性。综上所述,我们的研究结果表明,SARS-CoV-2的N蛋白在人类细胞中表现出VSR活性,这可能是新型冠状病毒的一个关键免疫逃避因子。
分类: 生物学 >> 病毒学 分类: 计算机科学 >> 计算机科学技术其他学科 提交时间: 2020-02-21
摘要: 新发传染病爆发流行期间,亟需提出候选药物功效与机制的科学假说。疫苗或新药研发均需要一定时间,因而药物重定位(老药新用)策略有其独特价值。但是新发疾病其病原体、宿主反应的临床数据不充分,制约了候选药物假设的提出。此阶段常根据病人临床特征进行广谱抗病毒药物的尝试。本文借鉴人工智能领域常见的启发式搜索思路,提出一种新方法(aCODE),基于前期有一定疗效提示的广谱抗病毒药,获得其宿主靶蛋白集合,在全基因组尺度上搜索与之相关性最高的基因模块组合,进而对候选化合物(如已批准上市药物、天然产物)进行模式匹配与统计检验排序。本方法可根据临床实践的进展更新输入药物,迭代输出更精准结果,输出的天然产物或中药、药食同源成分结合其它信息后可实施快速测试,形成敏捷研发测试闭环。本方法的第二版更新及其与文献证据的比对分析请参考:http://chinaxiv.org/abs/202002.00024。
分类: 生物学 >> 病毒学 提交时间: 2020-02-14
摘要: 摘要:2019年12月,中国武汉报道了2019新型冠状病毒(2019 novel Coronavirus,2019-nCoV)引起的肺炎。基于基因组信息,我们前期研究结果显示2019-nCoV与SARS冠状病毒虽然同属于Beta冠状病毒B亚群(BB冠状病毒),但两种病毒差异很大,这一结果与两者临床症状差异一致。前期研究还发现了BB冠状病毒存在大量的可变翻译,并从分子水平揭示了BB冠状病毒变异快、多样性高的特点。本研究在国际上首次报道BB冠状病毒S蛋白上的一个重要突变,这个突变使2019-nCoV具有了一个可供Furin蛋白酶切的位点,是除鼠肝炎冠状病毒外所有的其它BB冠状病毒(包括SARS和SARS样(SARS-like)冠状病毒)所不具有的。这个突变有可能增强了2019-nCoV侵染细胞的效率,进而使其传播力显著大于SARS冠状病毒。由于这个突变,2019冠状病毒的包装机制也会不同于SARS等其它大部分Beta冠状病毒,而有可能与鼠肝炎冠状病毒、HIV、埃博拉病毒和一些禽流感病毒的包装机制相同。作为一个意外发现,一些禽流感病毒也可以通过突变获得Furin蛋白酶切位点。对这个重要突变的后续研究将为揭示2019-nCoV传播力强的原因,以及为药物、抗体和疫苗的开发等工作奠定基础。