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  • 基于Ks 分布的被子植物演化的时间尺度研究

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 物种演化时间估算是生命演化研究的重要部分。近年来,许多研究发现不同基因和不 同物种的进化速率差异显著,因此需要新的方法对进化事件发生时间进行重新估计。为了对 被子植物演化时间的从新估计,基于共享多倍化事件或共享分歧事件应该有共同 Ks 峰值的 理念,建立了基于基因组数据的进化速率矫正模型,结果如下:(1)对获取 Ks 分布三种 常见的方式进行了比较分析,明确了通过提取共线性区块上 Ks 值的中位数的方式最优。(2) 模拟了 Ks 值随时间累积系数v 的变化过程下的 Ks 分布。当假设v 服从正态分布时,Ks 分 布出现了长尾现象。(3)将矫正方法在被子植物中的应用,发现不同谱系的被子植物具有 同步的辐射进化和适应性进化现象。而且被子植物的进化速率虽然差异显著,但不同分支间 的进化速率仍具有部分一致性。例如,木兰类植物进化速率最慢,真双子叶植物次之,单子 叶植物进化速率最快。最终得到了相对可靠的物种的演化时间轴,为植物研究提供系统发育 和演化的支撑。

  • 粉葛 PtCHI 基因的克隆、原核表达和亚细胞定位

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 为探究葛根品种间异黄酮类物质代谢关键酶基因 PtCHI 分子机制差异,以初步揭示 其品种间异黄酮物质含量差异原因。该研究分别以野葛品种和粉葛品种“桂葛 1 号”为材料, 经乙醇提取并通过高效液相对野葛和粉葛中葛根素和总黄酮的含量进行测定;基于已报道的 野葛 CHI 基因,通过同源克隆方法分离粉葛中 PtCHI 基因,并在体外进行蛋白表达,同时 在拟南芥原生质体中研究 PtCHI 基因的定位。结果表明:(1)野葛中的葛根素含量显著高 于粉葛,且野葛的总黄酮含量也高于粉葛但不达显著水平;(2)成功分离粉葛 PtCHI 基因, 长度为 742 bp 且包含 672 bp 完整的 ORF 框,编码 223 个氨基酸,与野葛的 CHI 基因具有 99%的同源性;(3)CHI 基因在粉葛中的表达量为茎>根>叶子,野葛中则为根>茎>叶子; 此外除了叶子,野葛中的CHI 基因的表达量均显著高于粉葛;(4)预测为稳定的亲水性蛋 白且大小为 27.8 kD,二、三级结构以α-螺旋为主,具有 25 个磷酸化位点,与野葛、大豆和 乌拉尔甘草的亲缘关系较近,和 F3H2、F3H、4CL4、DFR2 及 CHS 发生互作的可能性较大; (5)在体外成功诱导并分离到 27.8 kD 的 PtCHI 单一蛋白;(6)通过拟南芥原生质体进一 步揭示 PtCHI 主要定位在叶绿体。该研究为进一步解析粉葛和野葛中的黄酮类物质含量差 异的问题,以及 PtCHI 的功能验证和异黄酮代谢途径机理研究奠定基础。

  • 小花老鼠簕可培养细菌多样性及其生物学活性研究

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 小花老鼠簕(Acanthus ebracteatus)是一种生长在红树生态系统的珍稀真红树植物, 具有较高的药用价值。该文旨在通过研究小花老鼠簕内生及根际可培养细菌多样性,挖掘其 潜在新物种及具有特殊生物学活性的菌株。利用 7 种不同培养基,通过传统稀释涂布法对小 花老鼠簕各植物组织及根际土壤可培养细菌进行分离,基于16S rRNA 基因序列解析其内生 及根际细菌群落结构和多样性特征,并应用植物病原菌平板对峙实验和平铺捕食活性测试分 析其可培养细菌的抗菌活性。结果表明:(1)基于 16S rRNA 基因序列分析,发现从小花 老鼠簕的根、茎、叶、花及根际土壤中共分离得到 144 株可培养细菌,这些细菌隶属于 18 目 26 科 37 属 66 种,芽孢杆菌属(Bacillus)和链霉菌属(Streptomyces)为优势菌属,分 别占细菌种数的 15.1 %及 13.6 %;(2)拮抗多种植物病原菌试验结果表明,获得 29 株具 有拮抗植物病原菌活性的细菌,10 株具有广谱抑菌活性,其中链霉菌属菌株拮抗作用最强, 且菌株 Y129 为潜在新物种;(3)捕食活性测试结果显示有 5 株细菌对金黄色葡萄球菌 (Staphylococcus aureus)、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Multi-drug resistance Staphylococcus aureus)及大肠埃希氏菌(Escherichia coli)具有捕食活性,假单胞菌属菌株捕食活性最强, 其中菌株 Y90 为潜在新物种。综上,红树植物小花老鼠簕及其根际土壤中蕴含着丰富的细 菌种质资源且具有多种生物活性,可作为生防菌和药源菌的来源之一,该研究结果也为提高 红树植物小花老鼠簕的药效和栽培奠定了基础。

  • 水氮耦合对辣木幼苗根系形态特征的影响

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 辣木(Moringa oleifera)主要分布在热带地区,属落叶乔木,具有极高的经济价值和栽培用途。 为探究 12 种水氮组合处理对辣木根系形态的影响,该文共设置 3 种土壤水分梯度,包括 40%(W1)、60% (W2)、80%(W3)的田间饱和持水量,以及 4 种施氮水平 N0(0 g·株-1)、N1(0.6 g·株-1)、N2(1.8 g·株-1)、 N3(3.6 g·株-1),比较不同水氮组合处理对辣木幼苗粗根和细根性状(根长度、根表面积、根体积、根平均 直径、比根长、比表面积等)的影响。结果表明:(1)水处理对辣木幼苗粗根和细根的性状没有显著影响。 (2)氮处理对粗根的根长、根表面积、根体积、根平均直径和比表面积有显著影响,而仅显著影响了细根 的平均直径和比表面积。(3)两因素方差分析表明,水氮交互作用仅显著影响了细根根长;在相同的水处 理下,低氮促进而高氮则抑制辣木粗根和细根根长、根表面积和根体积的增加,表明低氮中水和低氮高水 处理在一定程度上促进根系生长。该研究结果表明,单一水处理的差异并没有显著改变辣木根系特性;低 氮促进而高氮抑制辣木根系的生长,且辣木粗根对氮处理的响应更敏感。水氮耦合对辣木根系生长有明显 的调控作用,低氮中水或低氮高水的组合模式更利于辣木根系生长。因此,为提高速生辣木的生长及生物 量的累积,在生产上应严格控制水和氮的使用量,严格水肥组合配比,有效提高水和氮肥的利用效率。

  • 桂北典型锰矿区周边土壤重金属污染状况及主要植物富集特征

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 为探究桂北某典型锰矿尾库区周边土壤和农作物重金属污染状况,筛选适合该地区污染土壤修复的 植物材料,在矿区周边采集 23 种主要植物及其根际土壤、9 种农作物并测定了 Cd、Mn、Cr、Pb 和 Zn 等 5 种重金属含量,采用单因子污染指数法和综合污染指数法评价了矿区农田土壤、农作物中重金属的生态 风险,通过计算植物对重金属的富集和转运系数评估其应用潜力。结果表明:(1)研究区土壤 Cd、Mn 污染最为严重,单因子污染指数分别为 18.53、147.09,达到重度污染级别;(2)研究区花生、小白菜等 作物可食用部位中的 Cd、Cr、Pb 含量均超过食品国家安全标准(GB 2762-2017)中的阈值,具有较高健 康风险;(3)23 种主要植物中青葙、鬼针草、一点红、蜈蚣草等对多种重金属转运系数大于 1,具备富 集型植物特征;一把伞南星、蓖麻、千里光等根部重金属含量较高,转运系数较低,具备根部囤积型植物 特征;响铃豆、筒轴茅、苣荬菜等富集的重金属含量相对较低,且在重金属污染土壤中能健康生长,具备 规避型植物特征。该研究结果表明,研究区土壤存在较严重的 Cd/Mn 复合污染,青葙等植物用于修复该复 合污染土壤极具应用潜力。

  • 氮添加对樟子松人工林氮转化及相关功能基因丰度的影响

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 土壤氮(N)的有效性是影响土壤微生物群落结构以及土壤氮循环的重 要因子,但关于N 添加对樟子松人工林土壤N 转化及N 功能基因(NFGs)表达 的影响却知之甚少。为探索N 添加对樟子松人工林氮素转化的影响及其作用机 制,该文以塞罕坝千层板林场的樟子松人工林为研究对象,进行了2 年的氮添加 处理,设置4 个不同氮添加水平0、1、5、10 gN m-2·year-1,分别记作N0、N1、 N5、N10,采用功能基因微阵GeoChip 5.0 系统及室内土壤培养法,探讨了土壤 NFGs 对氮添加的反应及其对氮转化过程的影响。结果表明,(1)与N0 相比, 中低N 添加处理(N1、N5)促进了氨化(ureC、nirA、nrfA)、硝化(amoA) 和反硝化(norB)相关基因的相对丰度,高N 处理(N10)则抑制了所有NFGs 的表达。(2)相关分析表明,N1、N5 的促进作用与土壤有机碳(SOC)、硝态氮 (NO3--N)和微生物生物量碳(MBC)显著相关,N10 处理显著降低了所有氮转化过 程NFGs 的相对丰度,这种负面影响与溶解性有机碳(DOC)、MBC 含量的减少 有关。(3)与氮转化基因丰度规律趋势相似,N1 和N5 处理显著增加了净N 硝 化、净N 矿化以及N2O 的排放速率,但N10 促进作用不明显,表明氮添加对氮 转化的促进作用存在阈值。(4)多元回归分析进一步表明amoA-AOB 和MBC 是影响净N 硝化的关键因素,ureC、nirK 和MBC 是影响净氮矿化的关键因素, narG、nirS 是影响N2O 排放的关键因素。综上,N 添加可提高促进樟子松人工 林的氮转化及提高部分特定酶功能基因的相对丰度,但氮添加水平存在阈值,当 施用10 g N m-2·year-1 时,氮转化受到抑制,添加5gN m-2·year-1 是促进樟子松 人工林土壤N 转化的较佳水平。

  • 漓江流域海拔、土壤及植被对土壤养分和酶化学计量比的影响

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 漓江流域海拔、土壤类型和植被类型多样。为研究其土壤养分和土壤酶活性特征,该研究以漓江流 域石灰性土壤及酸性土壤的典型植被类型(自然林、毛竹林、马尾松林、果园、水稻田)的表层土壤(0~20 cm) 为研究对象,测定土壤养分含量及碳氮转化相关胞外酶(淀粉酶、蔗糖酶、脲酶、蛋白酶、过氧化氢酶) 活性及化学计量比特征。结果表明:(1)高海拔土壤的全氮(TN)、全磷(TP)、有效磷(AP)含量和淀粉酶、蔗 糖酶、脲酶、蛋白酶活性相对较高,而过氧化氢酶活性则正好呈现相反的趋势。(2)相对于酸性土壤,石灰 性土壤有较高的 TP 和 AP 含量。酸性土壤中,植被类型对氮磷养分影响较大,人工植被总体上使得土壤氮 素降低而磷素增加;而石灰性土壤养分在不同植被类型间差异相对较小。(3)相比自然林,人工植被的土壤 氮转化酶活性极大降低,而土壤碳转化酶受人为影响程度相对较少,土壤氮磷酶活性化学计量揭示,自然 林呈现氮限制而人工林呈现碳限制。(4)典范对应分析(CCA)显示土壤理化性质在第Ⅰ轴和第Ⅱ轴解释了 86.56%的土壤酶活性变异,土壤理化性质解释贡献率排序:TN>pH>铵态氮(NH4+)>AP>TP>硝态氮(NO3-), 其中前三个因子是造成土壤酶活性差异的主要因子。综上结果表明,漓江流域的酸性土壤对人为干扰的生 态敏感性较高,植被变化易导致养分失衡,应注重土壤养分管理,防止土壤有机质的损失,提高漓江流域 景观资源可持续利用,该研究可为当地生态系统的科学保育和开发提供理论依据。

  • 广西木论国家级自然保护区植物物种多样性初步研究

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 广西木论国家级自然保护区位于我国滇黔桂植物区和华南植物区的交错地带,也是古 北极与古热带两大植物区系交接过渡的中心地带,在我国生物多样性保护区域中占据着不可 替代的地位。为摸清广西木论国家级自然保护区植物物种多样性,该文基于历史文献整理、 野外调查、标本采集和鉴定以及数据统计分析对该保护区维管束植物物种多样性组成及其特 点进行了研究。结果表明:(1)该区共有维管束植物 1 735 种,包括石松类和蕨类植物218 种,种子植物 1 517 种,具有较丰富的维管束植物多样性组成以及较复杂的植物区系成分。 (2)该区共有中国特有植物 486 种,广西特有植物 56 种,岩溶特有植物 262 种,具有显著 的植物特有性。(3)该区共有国家重点保护野生植物 68 种,广西重点保护野生植物 153 种,我国极小种群野生植物 4 种,受威胁植物 108 种,列入《濒危野生动植物种国际贸易公 约》(CITES)附录植物 144 种,具有较高程度的植物珍稀濒危性。综上结果,该区是我国 重要的岩溶植物基因库,具有极其重要的保护价值。该研究结果将为保护区的建设和管理、 植物保护和利用以及其他科研工作的开展提供重要依据。

  • Xitunaspis, a new eugaleaspid fish (Eugaleaspiformes, Galeaspida) from the Lower Devonian of Qujing, Yunnan

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2022-04-16 合作期刊: 《古脊椎动物学报》

    摘要: A new genus and species of the family Eugaleaspidae (Eugaleaspiformes, Galeaspida), Xitunaspis magnus gen. et sp. nov., is described from the Lower Devonian Xitun Formation in Qujing, Yunnan Province, China. The new genus displays the diagnostic characters of the Eugaleaspidae, including a slit-like median dorsal opening, no inner cornual process, developed median dorsal canals, and only three pairs of lateral transverse canals extending from lateral dorsal canals. Different from the other eugaleaspids, X. magnus possesses a large headshield with thick dermal bone and a more plesiomorphic sensory canal system. The phylogenetic analysis of the Galeaspida reveals that Xitunaspis clusters with Dunyu and Eugaleaspis to form a monophyletic clade Eugaleaspidae Liu, 1965, and has a closer relationship with Dunyu than Eugaleaspis by sharing the thick dermal bone of the headshield. The new finding represents the first convincing fossil record of the Eugaleaspiformes in the middle Lochkovian Xitun Formation and adds to our knowledge about the morphology of eugaleaspiforms and the evolutionary pattern of the sensory canal system in the Eugaleaspiformes and even Galeaspida.

  • New fossils of small and medium-sized bovids from the Early Pleistocene Site of Shanshenmiaozui in Nihewan Basin, North China

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2022-04-16 合作期刊: 《古脊椎动物学报》

    摘要: Shanshenmiaozui site in Nihewan Basin in North China is a recently discovered Early Pleistocene site which yields rich and diverse mammalian fossils. In the fauna, the small and medium-sized bovid fossils are well represented and can be referred to the following taxa: Spirocerus wongi, Gazella sinensis, Ovis shantungensis and Megalovis piveteaui respectively, among which G. sinensis is the dominate species. S. wongi and G. sinensis are mainly represented by horn-cores and partial skull bones as well as mandibles; in addition, metacarpal and/or metatarsal bones were also recognized for all of the four species. The horn-cores are easy to be identified to the species level, while the dentitions and the postcranial bones underwent a series of examinations and comparisons before getting properly determined and referred to the most approximate taxa. Among the postcranial bones, the metapodials, especially to the metacarpal bones special attentions were paid, which are crucial not only for taxonomic identification, but also for phylogenetic and paleoecological reconstructions; the previously misidentified metapodial specimens in Nihewan fauna were reconsidered in this paper. In the SSMZ fauna, the bovid guild is dominated by Gazella and Bison, which indicates steppe was the most important biome in Nihewan Basin during Early Pleistocene.

  • Attributing “Gomphotherium shensiense” to Platybelodon tongxinensis, and a new species of Platybelodon from the latest Middle Miocene

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2022-04-16 合作期刊: 《古脊椎动物学报》

    摘要: Platybelodon is the predominant proboscidean of northern China’s Middle Miocene. However, the cranial and cheek tooth morphologies are not clearly diagnosed. In particular, the differential diagnoses between Platybelodon and Gomphotherium have not been comprehensively examined. Here we restudied the cranium previously identified as Gomphotherium shensiense. The upper tusks lack an enamel band, the rostrum is long and narrow, the facial part is rostrally positioned, and a large “prenasal slope” is present. These characters are distinct from those of any species of Gomphotherium, but fit well with some primitive species of Platybelodon, i.e., P. tongxinensis and P. danovi. The molars are also close to the type specimen of P. tongxinensis in the tetralophodont M3 with mesiodistally wide interlophs, curved outline, and a tendency of cementodonty. In this article, we synonymized Gomphotherium shensiense with P. tongxinensis. Moreover, we recognized a new species, Platybelodon tetralophus, from the P. grangeri material collected by the AMHN expedition in Tunggur region. Platybelodon tetralophus differs from P. grangeri and the other species in the tetralophodont M2 and m2, representing the most derived species within Platybelodon. It has only occurred in the uppermost horizon of the Tunggur Formation, i.e., the Tamuqin Fauna (Platybelodon Quarry and Wolf Camp Quarry of AMHN). This work is a comprehensive amending of the genus Platybelodon.

  • A new species of Pararhizomys (Tachyoryctoidinae, Muroidea) from Linxia Basin of Gansu Province

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2022-04-16 合作期刊: 《古脊椎动物学报》

    摘要: An anterior part of skull was recently found near Xiayangwan in Guanghe County, Gansu Province, presumably from the Liushu Formation. The skull represents a new species of Pararhizomys, named as Pararhizomys parvulus. The new species is characterized by: small size, upper molars higher crowned and mesio-lingually hypsodont with sinus deeper than mesosinus; sinus and mesosinus in M3 being transverse and overlapping each other, but sinus longer than mesosinus on occlusal view. Based on shared apomorphies (lingually hypsodont upper molars and transverse sinus and mesosinus on M3 occulsal surface), P. parvulus and P. huaxiaensis are supposed to form a sister group. However, P. parvulus may be more derived than P. huaxiaensis as demonstrated by the more hypsodont molars and the deeper sinus in M3.