蛇足石杉COBRA 基因家族的分子生物信息学及表达分析

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2023-12-24 合作期刊: 《广西植物》

黄玉妹 滕建北 涂冬萍 梁柳观

摘要： 弄清蛇足石杉COBRA 基因家族成员分子生物信息学特征及组织表达规律，为 COBRA 基因进一步研究提供依据。基于蛇足石杉的全长转录组数据，通过生物信息学技术 对该家族成员（HsCOBRAs）的理化性质、结构域、保守基序、顺式作用元件、基因表达量 等进行分析。结果表明：（1）在蛇足石杉全长转录组中共筛选出24 个HsCOBRAs 家族成 员，其中酸性蛋白9 个，稳定蛋白11 个，疏水性蛋白5 个，具有跨膜结构的蛋白7 个，具 有信号肽的蛋白3 个。（2）亚细胞定位在细胞壁、叶绿体、细胞核、细胞膜上。（3）结构 分析发现HsCOBRAs 有7 种结构域和6 种保守基序，部分成员具有高度保守的CCVS 结构。 （4）HsCOBRAs 具有CAAT-box、TATA-box 等46 种顺式作用元件。（5）HsCOBRA2 在叶、 孢子、茎、芽胞中的表达量均最高。蛇足石杉COBRA 基因家族分子生物信息学及表达特征 可为HsCOBRAs 的进一步研究及生物学功能验证等提供理论依据。

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