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  • 基于简化基因组测序揭示水角的濒危机制

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2023-07-26 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 物种的遗传多样性是物种适应性和生存能力的关键因素。生境片段化是造成生物多样 性丧失的重要因素之一,其对植物种群的遗传多样性有着重要影响。水角(Hydrocera triflora) 处于地区性绝灭状态,其遗传多样性状况和濒危机制尚未有报到。该文收集了 7 个种群的 34 个水角样本,利用简化基因组测序技术(RAD-seq)获得了单核苷酸变异位点(SNP)。 通过种群遗传多样性和遗传结构的分析,并结合种群历史动态分析和不同气候情景下物种潜 在分布区预测,探讨了水角的濒危机制。结果表明:(1)水角遗传多样性较低(Ho=0.1569、 He=0.1654、Pi=0.186 5),遗传分化系数较高;AMOVA 分析表明,遗传变异主要发生种群 内;(2)Mantel 检测表明环境距离与遗传距离、地理距离均具有显著的正相关关系,分别 为 P=0.044 7 和 P=0.008 2;(3)水角的有效种群大小从全新世中期开始持续下降,琼北火 山群的爆发和人来活动起着不可忽视的影响;(4)生态位模拟表明与当代气候相比,在未 来气候变化下水角的潜在分布区总面积变动不大,但在高 CO2 排放的情景下,大量的高适 生区将会丧失并转化为低适生区,特别是位于马来群岛的适生区几乎完全消失。结果表明生 境片段化导致了水角较低的遗传多样性和有效种群大小的持续下降。因此,自身更新能力低 以及人为活动干扰、城市化等不利的环境条件是导致其濒危的主要原因。建议加强对水角的 就地保护,进行人工授粉等方法提高其基因流以增加其种群的遗传多样性。另一方面,要着 重保护湿地免遭破坏。

  • 基于MaxEnt 模型预测中国兰属植物的分布格局及主导气候因子

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2023-06-05 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 兰属(Cymbidium)所有种(除兔耳兰C. lancifolium 外)均被列为国家重点保护野 生植物,研究其在未来气候条件下的潜在分布格局,将对该类群的有效合理保护提供参考和 依据。该文基于兰属植物已知的分布点和19 个气候因子,利用MaxEnt 模型和地理信息系 统(ArcGIS)模拟兰属以及其中20 种兰属植物在九种不同气候情景(当代以及未来2030s、 2050s、2070s 和2090s 四个时间段各两种温室气体排放情景)下的潜在分布格局,并找出影 响兰属植物分布的主导气候因子。结果表明:(1)最干旱季降水量(Bio17)、年降水量(Bio12) 和温度季节性变化(Bio04)是影响兰属植物地理分布格局的主导气候因子。(2)从物种水 平上分析,不同兰属植物在未来情景下的适生区表现出不同的变化趋势,且影响其分布的主 导气候因子也有所不同。其中,冬凤兰(C. dayanum)等8 个物种的适生区面积总体呈扩张 趋势,而西藏虎头兰(C. tracyanum)等12 个物种的适生区面积整体则呈缩减趋势。该研究 将为兰属植物就地保护与迁地保护提供重要参考,对兰属等濒危野生植物的保护具有积极意 义。

  • 人巨细胞病毒抗原表位的重组表达及免疫原性分析

    分类: 生物学 >> 生物工程 提交时间: 2017-07-24 合作期刊: 《中国生物工程杂志》

    摘要: 目的 用大肠杆菌表达系统表达人巨细胞病毒(HCMV)pp65蛋白和gB蛋白的优势抗原表位基因,制成HCMV亚单位疫苗,探究其在Balb/c小鼠体内的体液免疫和细胞免疫活性。方法 选取pp65蛋白的490aa-508aa和gB蛋白的607aa-621aa的基因片段,经PCR扩增目的片段,连接表达载体pET-32a(+),转化BL21(DE3)plys菌株,十二烷基硫酸钠—聚丙稀酰胺凝胶(SDS-PAGE)分析蛋白表达,金属螯合亲和镍柱法纯化目的蛋白。重组蛋白免疫Balb/c小鼠,Western blotting法和间接ELISA法检测重组蛋白的体液免疫活性;通过流式细胞仪和双抗夹心ELISA法检测重组蛋白的细胞免疫活性。结果 获得相对分子质量约为22kDa的融合蛋白,Western blotting检测显示抗体有特异性,间接ELISA法检测其效价为1:102400。与对照组相比,实验组小鼠外周血中CD4+T细胞和CD8+T细胞的数量以及IFN-γ,IL-2,IL-12的含量有显著提高(P<0.01)。结论 制备的具有免疫优势抗原表位的重组蛋白能诱导小鼠产生较强的体液免疫和细胞免疫反应。