分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-07-20 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为了解不同基因型甘蔗(Saccharum officinarum)响应低温胁迫的分子机制，挖掘耐寒相关的 miRNA及相关靶基因，该文以低温胁迫4 ℃处理 24 h 后的3个不同耐寒性甘蔗品种的叶片为材料进行Illumina HiSeqTM2000 高通量测序，构建18 个低温胁迫前后sRNA文库。结果表明（：1）共获得分属于84个家族的已知miRNA 322个及预测得到110个新miRNA，并在已知 miRNAs中筛选出差异表达miRNA100个(61个上调，39个下调)，新miRNA中筛选出差异表达 miRNA37(15个上调, 22 个下调)。（2）利用 psRNATarget、TargetFinder 和Tapirhybrid软件对所获得的差异表达miRNA进行靶基因预测，预测得到1844个靶基因并进行GO 分析揭示了这些靶基因的3个主要功能类别，即分子功能、细胞组分与生物过程。（3）为验证高通量测序数据的可靠性，筛选 14 个miRNA 及其靶基因进行qRT-PCR 验证，表明这些 miRNA 均被检测发现且大部表达结果与测序结果一致。（4）还鉴定出部分差异表达miRNA的靶基因，这些基因参与植物生长、发育及低温胁迫反应。综上结果表明，耐寒型甘蔗体内 miRNA 直接或者间接作用靶基因实现表达调控相关代谢途径，对其重要农艺性状均起着关键的调控作用。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-08-02 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 半蒴苣苔（Hemiboea subcapitata）为苦苣苔科半蒴苣苔属多年生草本植物。该种形态变异幅度大，曾包括多个变种；分布范围广，在多种类型的生境基质上皆有分布。本研究包括典型半蒴苣苔和与之近缘，且曾被归为其变种的翅茎半蒴苣苔(H. pterocaulis)，以及我们新发现的与两者形态上分别最相近的另两种变异类型，对其关键形态、微形态的多样性进行了描述和比较；结合查阅标本、文献资料以及长期的野外追踪调查，统计分析了半蒴苣苔不同类型间的地理和生境分布；此外，通过DNA证据，初步重建各物种及变异类型间的系统发育和单倍型进化关系。研究结果表明：(1)通过茎、叶、花和开花物候等多性状组合能够区分半蒴苣苔复合群各类型。(2)半蒴苣苔复合群四类型间在叶表皮细胞形状和气孔分布等方面无甚区别；而在表皮毛的有无、复表皮层数、维管束数量和排布存上存在差别，或有助于分类。(3)典型半蒴苣苔广泛分布于我国中部至南部，向南延伸至越南北部，在石灰岩、丹霞等生境基质上皆有分布；翅茎半蒴苣苔仅分布于广西桂林市小部分区域的喀斯特山石灰岩基质上；而另两种变异类型则分布更为狭域，仅分布于桂林市永福县一个或相邻的数个喀斯特山石灰岩基质上。(4)DNA单倍型网络图分析表明，半蒴苣苔复合群四类型各自独享单倍型；但重建分子系统发育关系则表明，金钟山居群与翅茎半蒴苣苔聚为一支，两者亲缘关系最近但相互之间不成单系，金钟山居群是否为独立物种还需更多证据加以检验，而半蒴苣苔则与永福半蒴苣苔两者间互为单系，支持两者为独立物种。
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