分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2024-02-07 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 以秦巴山区3 种人参属药用植物为研究对象，运用生物信息学技术分析其叶绿 体基因组特征及密码子使用偏好性等，明确珠子参、羽叶三七和秀丽假人参3 种药用 植物叶绿体基因组特征与系统发育关系，为珠子参药材的分子鉴定提供依据。结果表 明：（1）3 种人参属药用植物的叶绿体基因组为典型的四分体结构，序列全长为156 071~156 104 bp，总GC 含量为38.10%，基因组大小相似度较高。（2）均注释到133 个基因，包括88 个蛋白编码基因、37 个tRNA基因和8 个rRNA 基因。（3）3 种 人参属药用植物叶绿体密码子使用偏好性相似，密码子第3 位碱基以A/U 结尾为主 ，密码子使用模式在受到突变影响的同时，主要受到自然选择的影响。（4）系统发育 结果表明3 种人参属药用植物的亲缘关系较近，且秀丽假人参同羽叶三七亲缘关系更 近。该研究表明秀丽假人参与珠子参基源植物之间存在近源关系，这项发现对于珠子 参中药材资源的开发利用具有重要意义，并为进一步研究人参属物种的分类、系统发 育和进化机制提供重要依据。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2022-08-05 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为探讨黑老虎（Kadsura coccinea）根际土壤和组织内生真菌菌群的组成及其生态 功能，该文采用ITS高通量测序技术对成熟黑老虎内生真菌（根、茎和叶）及根际土壤真菌 群落结构、多样性和生态功能进行了分析。结果表明：（1）12个样品共获得2 241个可操 作分类单元（OTU），涉及10个门、41个纲、95个目、212个科、367个属，内生真菌和根 际土壤真菌OTU数分别为1 453、386、536和258，其中共有的OTU为18个。在门水平上， 黑老虎内生真菌及根际土壤真菌优势群落均为子囊菌门和担子菌门，其中子囊菌门在叶片 和茎中占比分别高达96.99%和95.37%；在属水平上，根际土壤真菌中腐生真菌被孢霉属占 比较高（13.5%），而叶片和茎秆等生长旺盛的组织中，子囊菌门未分类属和痂囊腔菌属 占比较高。（2）多样性分析表明，黑老虎根际土壤真菌群落的丰度和多样性明显高于内 生真菌；茎中内生真菌丰度显著高于根和叶，而根、茎和叶组织间内生真菌多样性差异不 显著。PCoA结果显示，叶片和茎秆的真菌群落结构相似性更高。（3）利用FUNGuild数据 库对黑老虎内生真菌及根际土壤真菌群落进行功能预测分析，结果发现黑老虎根际土壤真 菌和内生真菌含有大量的未分类菌群。功能已分类菌群中，病理寄生型功能群在生长旺盛 的组织中占比较高。研究结果为黑老虎优异功能菌的筛选和发掘提供了理论依据。
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