分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2018-12-20 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 本试验旨在对1只死亡野生川金丝猴的胃肠道菌群多样性及其克隆测序条带的系统进化树进行分析。取死亡野生川金丝猴胃肠道内容物，进行聚合酶链式反应（PCR）-变性梯度凝胶电泳（DGGE）分析，结合条带的克隆测序、聚类分析和主成分（PCA）分析检测菌群多样性并构建系统进化树。结果显示：1）野生川金丝猴整个胃肠道栖息着大量细菌，且来自胃、小肠的样品聚为一大簇，来自大肠的样品聚为一簇，而来自粪便的样品单独聚为一簇。2）从DGGE图谱上共回收18个条带，细菌种类鉴定主要是5个菌门，分别为变形菌门（Proteobacteria，38.89%）、厚壁菌门（Firmicutes，22.22%）、拟杆菌门（Bacteroidetes，5.56%）、放线菌门（Actinobacteria，5.56%）、疣微菌门（Verrucomicrobia，5.56%）和不可培养菌（uncultured bacterium，22.22%）。其中，变形菌门和厚壁菌门分布于整个胃肠道。3）菌群的系统进化树分析表明，仅有1种不可培养菌与已鉴定的粪肠球菌进化分类相似，而其他不可培养菌与已知的菌种进化分支差异较大，说明在野生川金丝猴的胃肠道中仍有大量的菌群信息未被鉴定。结果提示，本试验测定的1只死亡野生川金丝猴的胃肠道优势菌群为变形菌门，菌群多样性随着胃肠道由前至后的顺序呈现高-低-高的趋势。
分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-11-07 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 本试验旨在研究小熊猫胃肠道菌群多样性。采用聚合酶链式反应（PCR）-变性梯度凝胶电泳（DGGE）技术结合条带的克隆测序、聚类分析和主成分分析（PCA）检测小熊猫胃肠道菌群结构及多样性。结果表明：1）PCR-DGGE图谱显示小熊猫胃肠道中有大量菌群，且不同部位的菌群结构存在一定的差异，相邻肠段菌群结构具有一定的相似性。结肠和粪便样品的菌群多样性较高，其次为胃和直肠样品，而空肠和回肠样品菌群多样性较低。2）小熊猫胃肠道菌群PCR-DGGE图谱中测序的条带大多数归为厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroides）、变形菌门（Proteobacteria）和疣微菌门（Verrucomicrobia），共性条带主要是未培养拟杆菌门细菌（uncultured Bacteroidetes bacterium）、粪肠球菌（Enterococcus faecalis）、未培养梭状芽孢杆菌（uncultured Clostridium sp.）、乳酸乳球菌（Lactococcus lactis）和食窦魏斯氏菌（Weissella cibaria），其中厚壁菌门为优势菌群；特异性条带主要是丛毛单胞菌（Comamonas sp.）、梭菌属（Clostridium sp.）和Akkermansia。由此可见，小熊猫胃肠道中栖息着大量菌群，且其多样性按照胃肠道由前至后的顺序呈现高-低-高的趋势。
分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-10-23 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 本试验旨在探究丁酸梭菌CBM01的最佳碳、氮源及其对胃肠道的耐受性。采用控制变量的方法，以梭菌增菌培养基为基础，对丁酸梭菌CBM01的碳、氮源进行优化，同时对其胃肠道耐受性进行研究。结果显示：1）丁酸梭菌CBM01的最佳碳源和最佳氮源分别为葡萄糖和蛋白胨；2）丁酸梭菌CBM01在人工胃液和人工肠液中作用3 h后，存活率分别为90.33％和92.09％；3）丁酸梭菌CBM01可耐受的最高胆盐浓度为0.40%。由此可见，丁酸梭菌CBM01对胃肠道环境具有良好的耐受性，是一株开发潜力巨大、应用前景广阔的益生菌。
分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-10-11 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 本试验旨在研究健康肉鸡回肠的微生物群落结构及功能。采用高通量测序技术对15只鸡的回肠内容物进行测序，按照97%的相似度归类OTUs，去除序列数量少的OTUs（n＜2），然后进行生物信息学分析及PICRUSt基因预测。结果表明：1）共获得424 062条tags，并归类于1 002个非单OTUs，样品平均tags为（28 271±8 855）条，平均OTUs为（261±82）个。2）所有样品共含有20个菌门，160个菌属。其中，共享核心菌门4个，分别是厚壁菌门（85.35%）、变形菌门（6.09%）、蓝细菌门（2.15%）和放线菌门（0.16%）。共享核心菌属19个，占样品总微生物总量的93.75%。3）鸡回肠预测得出328个功能。从前20功能热图可知，各样品的效能存在差异。由此可见，鸡回肠微生物群落复杂，但主要菌群相对稳定。本试验为进一步研究鸡回肠微生物群落结构与功能提供参考依据。
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