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  • 基于质体基因组学方法研究广义玄参科的系统发育

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-08-05 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 本研究利用GenBank 数据库已公开发表的玄参科及相关类群的107 属129 个物种的质体基因组数据对广义玄参科的系统发育关系进行了分析。利用蛋白质 编码基因,我们构建了矩阵,并采用最大似然法及贝叶斯推断重建系统发育树。 基于两种分析方法,我们获得了拓扑结构完全一致的系统发育树,系统发育树的 分辨率及支持率高。在ML 树中,总分支数为129 个,其中支持率70%的分支 数目为123 个。系统发育树结果表明,(1)广义玄参科不是一个单系类群,隶属 于广义玄参科的51 个物种(37 属)分散于列当科、泡桐科、美丽桐科、通泉草 科、母草科、狭义玄参科和车前科。(2)狭义玄参科为单系类群,除原隶属于广 义玄参科的Bontia 、Calamphoreus 、Diocirea 、Eremophila 、Glycocystis 、 Leucophyllum、玄参属和毛蕊花属外,还包括了原隶属于马钱科的醉鱼草属和原 隶属于苦槛蓝科的苦槛蓝属。(3)唇形目为一个单系,目下共形成了14 个支持 率高的单系分支,对应于14 个科(其中美丽桐科和胡麻科仅包括一个物种,不 包括在内),科间关系得到较好的解决,木犀科为最早分化出来的类群,其余的 类群共同组成核心唇形目,在核心唇形目中,类群分化的次序依次为苦苣苔科、 车前科、玄参科和母草科,其余的科聚成两个大的分支,其中一个大分支包括5 个科,紫葳科、马鞭草科和胡麻科形成中等支持率的一个亚支,其中紫葳科、马 鞭草科为姐妹群;爵床科和狸藻科亦形成中等支持率的一个亚支;另一个大分支 包括了6 个科,类群分化的次序依次为唇形科、通泉草科、美丽桐科+透骨草科, 泡桐科和列当科为姐妹群,为较进化的类群。我们的研究结果表明,传统意义上 的玄参科不是一个自然类群,其包括的种属分散于唇形目;质体基因组适用于解 决广义玄参科的系统发育关系,有待于扩大样本进一步研究。

  • 云锦杜鹃不同花期挥发性成分的 HS-SPME-GC-MS 检测与主成分分析

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2020-04-03 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 为了探究云锦杜鹃的挥发性成分,该研究采用顶空固相微萃取-气相色谱-质谱联用技术对云锦杜鹃不同花期中的挥发性成分进行定性定量分析,并通过主成分分析法分析其特征挥发性成分。结果表明:4β -月桂烯、β -罗勒烯、可巴烯、异喇叭烯、桉树脑、 衣兰烯、(+)-表二环倍半水芹烯、(3R-反式)-4-乙烯基-4-甲基

  • 广藿香FPPS基因原核表达及茉莉酸甲酯对FPPS表达量的影响

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2020-03-24 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase, FPPS)是广藿香甲羟戊酸途径中萜类物质生物合成的关键酶,其催化异戊二烯焦磷酸( IPP) 和二甲基烯丙基焦磷酸(DMAPP)合成萜类物质前体法尼基焦磷酸。为了进一步研究广藿香萜类合成途径的分子机制,本研究通过逆转录聚合酶链式反应获得PTS基因的cDNA序列,利用生物信息学软件预测FPPS编码蛋白的理化性质、结构和功能。结果表明该序列的开放阅读框全长1 050 bp,编码349个氨基酸,预测分子量为40 KD,等电点为5.43,存在一个结构域,参与异戊二烯化合物的合成,不存在信号肽,亚细胞定位于细胞质;系统发育分析表明广藿香FPPS氨基酸序列和丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)、撒尔维亚(Salvia officinalis Linn)的氨基酸序列亲缘关系最近。其次,为研究其蛋白的表达情况,该文使用无缝克隆技术构建pET-32b-FPPS原核表达载体,并导入菌株BL21(DE3)中,考察不同浓度异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)对诱导融合蛋白的表达量的影响。结果发现融合表达蛋白以包涵体形式存在沉淀中,4个浓度的IPTG诱导蛋白表达效果差异不明显。最后,为研究茉莉酸甲酯(MeJA)对FPPS表达量的影响,该文采用荧光定量技术分析0.1、0.25 mmol·L-1 MeJA对FPPS基因表达水平的影响,发现0.1 mmol·L-1 MeJA诱导后FPPS基因的表达量的趋势是先升高后降低再升高再降低;0.25 mmol·L-1 MeJA诱导后FPPS基因的表达量的趋势是先降低后升高再降低。推测植物体内MeJA浓度的变化能影响FPPS基因的表达,高浓度具抑制作用,低浓度具促进作用。本研究为广藿香萜类合成途径的研究奠定基础,为后续基因功能验证提供理论参考。

  • 磷酸一二钙对肉鸭相对生物学利用率的研究

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2018-12-25 合作期刊: 《动物营养学报》

    摘要: 本试验采用双因子随机分组试验设计,旨在研究磷酸一二钙(MDCP)和磷酸氢钙(DCP)及其添加水平(前期为0.075%、0.150%、0.225%、0.300%和0.375%,后期为0.12%、0.18%、0.24、0.30%)对肉鸭生长性能、血清生化指标和胫骨指标的影响,以评价MDCP对肉鸭的相对生物学利用率。试验前期(1~21日龄)共选用960只1日龄樱桃谷肉鸭,随机分成10个组,每组6个重复,每个重复16只鸭;试验后期(22~42日龄)选用720只22日龄樱桃谷肉鸭,随机分成8个组,每组6个重复,每个重复15只鸭。试验期42 d。结果表明:1)1~21日龄,随着MDCP或DCP添加水平由0.075%上升到0.225%,肉鸭的平均日增重和平均日采食量显著提高(P<0.05);0.075% MDCP添加组肉鸭的料重比显著高于其他MDCP添加组(P<0.05)。22~42日龄,0.12% MDCP或DCP添加组肉鸭的平均日增重、平均日采食量显著低于其他MDCP或DCP添加组(P<0.05);0.12% DCP添加组肉鸭的料重比高于其他DCP添加组(P>0.05),0.30% MDCP添加组的料重比显著低于其他MDCP添加组(P<0.05)。2)磷来源与添加水平互作显著影响21日龄肉鸭的胫骨强度(P<0.05),MDCP添加组肉鸭的胫骨强度显著高于DCP添加组(P<0.05);磷添加水平对21日龄肉鸭胫骨指标的影响显著(P<0.05)。42日龄肉鸭的胫骨灰分、钙、磷含量以及胫骨强度随着磷添加水平的增加而线性升高;磷来源与添加水平互作对42日龄肉鸭胫骨钙含量的影响显著(P<0.05)。3)21日龄,MDCP添加组肉鸭的血清磷含量显著低于DCP添加组(P<0.05),0.075% MDCP或DCP添加组血清钙、磷含量显著高于其他MDCP或DCP添加组(P<0.05),0.075%、0.150% MDCP或DCP添加组血清碱性磷酸酶活性显著高于其他MDCP或DCP添加组(P<0.05)。42日龄,肉鸭血清磷含量和碱性磷酸酶活性随DCP或MDCP添加水平的升高而逐渐降低,0.12% DCP添加组的血清磷含量显著高于其他DCP添加组(P<0.05)。结果提示,MDCP可以替代DCP作为肉鸭饲粮的磷来源;MDCP为磷来源时,1~21日龄肉鸭适宜的非植酸磷水平为0.355%,22~42日龄肉鸭适宜的非植酸磷水平为0.305%。综合肉鸭体重、体增重和胫骨矿化指标,肉鸭MDCP相对于DCP(100%)的生物学利用率是109.85%。

  • 不同方法处理的全株玉米青贮与玉米秸秆青贮对肉牛生长性能及经济效益的影响

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2018-12-24 合作期刊: 《动物营养学报》

    摘要: 本试验旨在研究全株玉米与玉米秸秆在添加和不添加青贮添加剂的情况下,青贮品质的差异以及对肉牛生长性能及经济效益的影响。选取120头西门塔尔杂种牛(18月龄左右、平均体重450 kg)作为试验动物,随机分为4组,每组6个重复,每个重复5头牛。试验设计4种含不同粗饲料的试验饲粮,分别为全株玉米青贮饲粮(WS组)、全株玉米加菌青贮饲粮(WS-L组)、玉米秸秆青贮饲粮(CS组)和玉米秸秆加菌青贮(CS-L组)饲粮。试验分为2期,其中预试期10 d,试验前期、后期各40 d。结果表明:1)添加青贮添加剂显著降低了全株玉米青贮的中性洗涤纤维(NDF)、酸性洗涤纤维(ADF)含量(P<0.05),同时增加了干物质(DM)、粗蛋白质(CP)含量(P>0.05),在一定程度上改善了全株玉米青贮的青贮品质。2)各组之间平均日干物质采食量差异不显著(P>0.05);相比CS组,CS-L组的平均日增重增加,料重比降低,但差异均不显著(P>0.05);与CS、CS-L组相比,WS和WS-L组的平均日增重显著增加(P<0.05),料重比显著降低(P<0.05)。3)WS-L组血清总胆固醇(TC)含量显著低于CS-L组(P<0.05),其余各项血清生化指标各组之间差异均不显著(P>0.05)。4)WS-L组每日利润最高,为10.98元/(头·d),比WS组略有增加,比CS和CS-L组分别增加了51.66%、50.62%。综合分析表明,添加青贮添加剂改善了全株玉米青贮的青贮品质,对玉米秸秆青贮的青贮品质无显著影响;相比玉米秸秆青贮,全株玉米青贮提高了西门塔尔杂交肉牛的生长性能,增加了经济效益。

  • 谷氨酸脱氢酶缺失对单核细胞增生李斯特菌生物被膜、毒力以及胞外蛋白表达的影响

    分类: 生物学 >> 生物工程 提交时间: 2018-06-14 合作期刊: 《中国生物工程杂志》

    摘要: 【目的】探究谷氨酸脱氢酶缺失对单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes, Lm)生物被膜、毒力以及胞外蛋白表达的影响。【方法】利用微孔板法,检测谷氨酸脱氢酶缺失对Lm生物被膜形成能力的影响;比较野生株、谷氨酸脱氢酶缺失株EGDe∆gdhA以及回复菌株EGDe∆gdhA+pERL3-gdhA的溶血活性以及对棉铃虫幼虫的半数致死量,检测谷氨酸脱氢酶缺失对Lm毒力的影响;利用iTRAQ技术对Lm野生株EGDe与谷氨酸脱氢酶缺失株EGDe∆gdhA的胞外蛋白进行分离与鉴定,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析。【结果】与野生株相比,缺失株形成的生物被膜量显著降低(P≤0.01),溶血活性下降,对棉铃虫幼虫的半数致死量上升了1.6倍;蛋白质组学结果显示,缺失谷氨酸脱氢酶后差异性表达的胞外蛋白有62个,其中47个蛋白表达量下调,15个蛋白表达量上调。进一步将这些差异表达蛋白质同COG数据库进行比对以及功能聚类分析,结果显示,这些蛋白质的功能分别属于碳水化合物转运与代谢、核苷酸转运和代谢、能量合成与转运相关、 转录以及细胞膜细胞壁相关蛋白等16个功能类别;其中碳氮代谢以及能量转运相关蛋白数量最多,为24个,占所鉴定出的差异蛋白总量的38.71%。表明谷氨酸脱氢酶是单核细胞增生李斯特菌中碳氮代谢和能量转运中的关键酶。同时,我们发现有3个与细菌粘附以及生物被膜形成相关的蛋白表达量下降。以上结果较好地解释了EGDe∆gdhA在基础培养基中生长缓慢和生物量显著性下降,以及生物被膜形成能力降低的现象。【结论】谷氨酸脱氢酶在单核细胞增生李斯特菌生物被膜、毒力以及胞外蛋白表达方面有重要作用。

  • 自组装短肽R2I4R2对皮肤创伤快速修复过程的研究

    分类: 生物学 >> 生物工程 提交时间: 2017-12-22 合作期刊: 《中国生物工程杂志》

    摘要: 研究探索自组装短肽R2I4R2在人皮肤成纤维细胞体外三维培养的应用效果与对创伤修复过程的作用。通过圆二色谱仪分析不同理化条件对其二级结构的影响;刚果红染色宏观检测短肽自组装情况;体外培养人皮肤成纤维细胞探索细胞在R2I4R2形成的纳米纤维网络中的生长状态及凋亡情况;建立SD大鼠皮肤创伤模型,HE染色与免疫组织化学检测其对皮肤创伤修复的病理变化。结果表明,R2I4R2在不同条件下均可形成较为稳定的二级结构;自组装24h后可形成均一稳定的膜片状装结构,为细胞三维培养提供支架;人皮肤成纤维细胞可在R2I4R2形成的纳米纤维网络三维环境中生长且状态良好;动物实验表明,短肽R2I4R2可减少炎症、促进新生血管生成、加速皮肤创伤修复过程。自组装短肽R2I4R2作为新的纳米支架材料,可用于细胞三维培养与皮肤创伤修复。

  • 饲料中添加壳寡糖和/或霉菌毒素吸附剂对凡纳滨对虾生长性能、非特异性免疫力及抗病力的影响

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2017-11-08 合作期刊: 《动物营养学报》

    摘要: 本试验旨在研究在饲料中单独或联合添加壳寡糖(COS)和硅铝酸盐类霉菌毒素吸附剂(MA)对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)生长性能、非特异性免疫力及抗病力的影响。首先配制基础饲料(C0组,作为对照组),然后在基础饲料中分别添加100 mg/kg COS(C0.1组)、250 mg/kg COS(C0.25组)、2 500 mg/kg MA(M2.5组)、100 mg/kg COS+2 500 mg/kg MA(C0.1+M2.5组)、250 mg/kg COS+2 500 mg/kg MA(C0.25+M2.5组),共制成6种等氮等脂的试验饲料,投喂初重为(0.23±0.02) g的凡纳滨对虾8周。每组设3个重复,每个重复放养40尾对虾。结果表明:1)C0.1+M2.5组的特定生长率、增重率显著高于M2.5组(P<0.05),C0.1+M2.5组的饲料系数最优,显著低于其他各组(P<0.05),C0.1+M2.5组的蛋白质效率最高并显著高于除C0.25+M2.5外的其他各组(P<0.05);C0.1+M2.5组的虾体粗蛋白质含量较C0.1组显著升高(P<0.05),虾体粗脂肪含量较C0.1组显著降低(P<0.05)。2)C0.1+M2.5、C0.25+M2.5组血清中AKP活性均显著低于C0.1和C0.25组(P<0.05),C0.1+M2.5组血清中SOD、PO活性均显著高于M2.5和C0.1组(P<0.05),C0.1+M2.5组血清中MDA含量显著低于C0.1组(P<0.05);C0.1+M2.5组肝胰腺中MDA含量显著低于C0.1组(P<0.05),C0.25+M2.5组肝胰腺中AKP、PO、SOD、LZM活性比C0.1+M2.5组均有降低,相反肝胰腺中MDA含量则有所升高。3)以哈维氏弧菌攻毒7 d后,C0.1+M2.5及C0.25+M2.5组的累积死亡率均显著低于C0和M2.5组(P<0.05)。由结果可知:本试验条件下,饲料中添加一定量的COS和/或MA均能促进凡纳滨对虾的生长,联合添加COS与MA的促生长、提高免疫力和抗病力的效果优于单独添加COS和MA,综合来看,以100 mg/kg COS和2 500 mg/kg MA联合添加时作用效果较佳。

  • 苜蓿皂苷对大鼠肝脏及肝脏细胞低密度脂蛋白受体、三磷酸腺苷结合盒转运体mRNA表达的影响

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2017-10-23 合作期刊: 《动物营养学报》

    摘要: 本试验旨在研究苜蓿皂苷对大鼠肝脏及大鼠肝脏细胞(BRL细胞)胆固醇清除和转运途径中关键基因低密度脂蛋白受体(LDLR)、三磷酸腺苷结合盒转运体G5(ABCG5)、三磷酸腺苷结合盒转运体G8(ABCG8)mRNA表达量的影响,从个体和细胞水平初步探讨苜蓿皂苷调控胆固醇清除和转运的分子机制。采用高脂饲粮建立大鼠高脂模型,测定苜蓿皂苷对正常、高脂大鼠血清指标[总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)含量]和肝脏LDLR、ABCG5、ABCG8 mRNA表达量的影响;采用高糖DMEM培养液建立BRL细胞脂变模型,测定苜蓿皂苷浓度对BRL细胞活性的影响,测定苜蓿皂苷对正常、脂变细胞LDLR、ABCG5、ABCG8 mRNA表达量的影响。结果表明:1)苜蓿皂苷显著降低高脂大鼠血清中TG、TC和LDL-C的含量(P0.05)。结果提示,苜蓿皂苷可通过调控LDLR、ABCG5、ABCG8 mRNA的表达来增加肝细胞内胆固醇的清除和转运,从而降低机体胆固醇的含量。

  • 苜蓿皂苷对断奶仔猪生长性能、肠道菌群、组织抗氧化能力及相关酶mRNA表达的影响

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2017-10-11 合作期刊: 《动物营养学报》

    摘要: 本试验旨在研究苜蓿皂苷对断奶仔猪生长性能、肠道菌群、组织抗氧化能力及相关酶mRNA表达的影响。选取24头平均体重为8 kg的大×长杂交断奶仔猪,随机分为2组,每组3个重复,每个重复4头猪。对照组饲喂基础饲粮,苜蓿皂苷组饲喂在基础饲粮中添加0.25%苜蓿皂苷的饲粮。预试期10 d,正试期30 d。结果表明:1)与对照组相比,饲粮中添加苜蓿皂苷可显著提高断奶仔猪平均日增重(P<0.05),并显著降低料重比(P<0.05)。2)与对照组相比,饲粮中添加苜蓿皂苷可显著降低仔猪十二指肠和盲肠的pH(P<0.05),显著提高十二指肠、空肠和回肠中乳酸菌数量(P<0.05)。3)与对照组相比,饲粮中添加苜蓿皂苷可显著提高仔猪肝脏和肾脏中谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)和过氧化氢酶(CAT)活性(P<0.05),并显著提高仔猪肝脏和空肠中GSH-Px mRNA表达量及十二指肠和回肠中CAT mRNA表达量(P<0.05)。综上,苜蓿皂苷可以提高断奶仔猪生长性能,增强其组织抗氧化能力并有效改善其肠道菌群。

  • 苜蓿皂苷对断奶仔猪生长性能、肠道菌群、组织抗氧化能力及相关酶mRNA表达的影响

    分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2017-10-10 合作期刊: 《动物营养学报》

    摘要: 本试验旨在研究苜蓿皂苷对断奶仔猪生长性能、肠道菌群、组织抗氧化能力及相关酶mRNA表达的影响。选取24头平均体重为8 kg的大×长杂交断奶仔猪,随机分为2组,每组3个重复,每个重复4头猪。对照组饲喂基础饲粮,苜蓿皂苷组饲喂在基础饲粮中添加0.25%苜蓿皂苷的饲粮。预试期10 d,正试期30 d。结果表明:1)与对照组相比,饲粮中添加苜蓿皂苷可显著提高断奶仔猪平均日增重(P<0.05),并显著降低料重比(P<0.05)。2)与对照组相比,饲粮中添加苜蓿皂苷可显著降低仔猪十二指肠和盲肠的pH(P<0.05),显著提高十二指肠、空肠和回肠中乳酸菌数量(P<0.05)。3)与对照组相比,饲粮中添加苜蓿皂苷可显著提高仔猪肝脏和肾脏中谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)和过氧化氢酶(CAT)活性(P<0.05),并显著提高仔猪肝脏和空肠中GSH-Px mRNA表达量及十二指肠和回肠中CAT mRNA表达量(P<0.05)。综上,苜蓿皂苷可以提高断奶仔猪生长性能,增强其组织抗氧化能力并有效改善其肠道菌群。