分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-08-09 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为了深入发掘日本厚朴、厚朴、凹叶厚朴叶绿体基因组差异,筛选厚朴优良性状候选基因，开展三种厚朴的分子遗传研究，该文利用 Illumina HiSeq 高通量测序平台首次对日本厚朴叶绿体进行测序、组装，并与已有的厚朴、凹叶厚朴叶绿体基因组共同注释，获得三个物种叶绿体基因图谱，筛选出三个基因组中的差异基因，又与同科中 11 个亲缘物种进行叶绿体基因组比对，构建 NJ 遗传树。结果表明：日本厚朴叶绿体基因组的 Clean Reads 为 19 791 019，Q30 为 91.33%，组装后基因组全长 160 051 bp，GC 含量为 39.2%，含 tRNA 37 个，rRNA 8 个。比对分析发现三种厚朴具有相似的 IR、LSC 和 SSC 结构，以及 GC 含量和 tRNA 数量，但编码基因种类和数量、内含子和外显子的数量和结构等存在差异。日本厚朴的功能基因数目较厚朴、凹叶厚朴分别多 6 个和 4 个，主要分布于 LSC 区和 IR 区，涉及核糖体大亚基、核糖体小亚基和未知功能基因类群。系统发育分析结果进一步显示日本厚朴与凹叶厚朴亲缘关系较近，其次是厚朴。该研究表明日本厚朴具有更丰富的叶绿体基因组结构、组成和变异特征，是其适应高纬度地区弱光、低温环境的分子机制，这为厚朴类优良品种的分子选育提供有力的指导。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-05-28 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 厚朴为著名的传统药用植物，归于木兰科、木兰属，于我国广泛种植，其树皮、根皮、枝皮、叶片、花、果实均能入药或食用。为获取厚朴全基因组序列信息，以厚朴叶片DNA为材料，该文采用Pacbio Sequel第三代测序技术构建厚朴全基因组数据库，并利用生物信息学方法对获得的核苷酸序列进行组装、功能注释以及进化分析研究。结果表明：原始测序数据过滤后获得140.91 Gb三代数据，Read N50约为13 784 bp，经过组装得到厚朴基因组大小为1.68 Gb，Contig N50约为222 069 bp，单拷贝基因完整性为78.05 %。组装后的序列通过与NR、KOG、KEGG等功能数据库比对，共有98.40 %的基因得到了功能注释，其中KOG功能注释结果发现厚朴的蛋白功能主要集中在一般功能预测、翻译后修饰、蛋白质转换、伴侣以及信号转导机制；GO功能分类表明厚朴的基因集中在细胞组分及生物学过程；KEGG分析发现厚朴参与代谢通路的基因占主要地位。通过与葡萄、拟南芥、水稻、杨树、银杏、无油樟、茶树及牛樟基因组的比对分析，发现厚朴23 424个基因中有20 801个基因可以分类到12 129个家族，其中有515个基因家族是厚朴所特有的，而厚朴与牛樟（樟科）亲缘关系较近，两者的分化时间约在122.5百万年前(mya)。该研究首次利用第三代测序技术对厚朴全基因组解析，有利于对其进一步进行深入的开发与利用，也为研究其它药用植物全基因组奠定了基础。
分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2018-12-24 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 本试验旨在研究富硒酵母和枯草芽孢杆菌对湖羊断奶羔羊生长性能、血清指标、养分表观消化率、胰腺消化酶活性和瘤胃发酵参数的影响。选取体况良好、体重为（9.65±0.38） kg的湖羊断奶羔羊21只随机分为3组，即对照组、富硒酵母组（在精料中添加100 g/t富硒酵母）和枯草芽孢杆菌组（在精料中添加100 g/t枯草芽孢杆菌），每组7只。试验期为28 d。结果表明，与对照组相比：1）富硒酵母组和枯草芽孢杆菌组的羔羊末重、平均日增重显著或极显著提高（P<0.05或P<0.01），精料和粗料的料重比显著或极显著降低（P<0.05或P<0.01）。2)富硒酵母组和枯草芽孢杆菌组血清中免疫球蛋白A、免疫球蛋白G、免疫球蛋白M、白细胞介素6含量及谷胱甘肽过氧化物酶活性显著或极显著提高（P<0.05或P<0.01）；富硒酵母组血清中丙二醛含量显著降低（P<0.05），血清白细胞介素1含量、超氧化物歧化酶活性显著或极显著提高（P<0.05或P<0.01）；枯草芽孢杆菌组的白细胞介素2、γ干扰素含量显著或极显著提高（P<0.05或P<0.01）。3)富硒酵母组和枯草芽孢杆菌组的干物质、粗蛋白质、酸性洗涤纤维和中性洗涤纤维的表观消化率显著或极显著提高（P<0.05或P<0.01），枯草芽孢杆菌组的粗脂肪的表观消化率显著提高（P<0.05）。4)枯草芽孢杆菌组胰腺脂肪酶和富硒酵母组胰腺胰蛋白酶显著提高（P<0.05）。5)富硒酵母组和枯草芽孢杆菌组羔羊瘤胃液氨态氮、乙酸、丙酸、异丁酸、正丁酸含量均显著提高（P<0.05）。结果证实，在湖羊断奶羔羊饲粮中添加富硒酵母和枯草芽孢杆菌可以提高羔羊生长性能和抗氧化能力，改善免疫力和消化功能。
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