白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2022-02-14 合作期刊: 《广西植物》

张倩 张德全

摘要： 白花刺续断是藏区一种常用的药用植物，但其叶绿体全基因组的研究较少。为揭示该 物种叶绿体全基因组的基本特征并探讨其谱系遗传结构，该研究利用 Illumina 测序平台对来 自 5 个野生居群的 10 个白花刺续断个体进行二代测序，经组装、注释，得到10 条完整的叶 绿体全基因组序列，并对它们的基因组特征和居群间的谱系进化关系进行了初步研究。研究 结果表明：（1）白花刺续断的叶绿体全基因组大小为 155 335~156 266 bp，共注释 113 个基 因，包括 72 个蛋白编码基因、30 个 tRNA 基因和 4 个 rRNA 基因，其叶绿体基因组的大小、 结构、GC 含量及基因组成等方面在种内高度保守；（2）基因组比较分析表明，白花刺续断 变异较大的片段均位于单拷贝区，且 IR 边界未出现明显的扩张和收缩；（3）群体遗传分析 发现，白花刺续断的野生居群具有明显的地理遗传结构，不同居群间在遗传距离与地理距离 上具有一定的相关性。该研究表明，白花刺续断叶绿体基因组在种内居群水平上比较保守， 且叶绿体基因组可在居群水平上揭示物种的地理遗传结构。这为后续开展刺续断属物种群体 遗传学和系统发育基因组学研究奠定了基础。

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