分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-01-12 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 阴地蕨是蕨类阴地蕨科阴地蕨属常用植物药，其生长发育有一定的代表性，为获得其转录组等生物学信息进行了二代测序和分析。该文以新鲜阴地蕨全株为材料，用Illumina HiSeq 2500 平台进行全转录组测序，干净序列经组装后得单一基因（ Unigene ） ， 将Unigene 在非冗余蛋白/ 核酸数据库（ nonredundant protein database,Nr）、核酸序列数据库（Nucleotide Sequence Database，Nt）、基因本体论数据库（gene ontology,GO）、蛋白质真核同源数据库（clusters of eukaryotic orthologous groups,COG ） 、东京基因与基因组百科全书（ Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）、蛋白质序列数据库SwissProt 和Interpro 进行生物信息学分析。结果显示共获得干净序列6.67 Gb ，组装后得到58 646 个Unigene，平均长度1 023bp，Unigene 在上述数据库的总体注释率为69.25%，其中，在GO 数据库中20 762个基因被注释到生物功能、细胞组分和分子功能3 个本体的52 个功能组，COG 注释了20 633 个基因并将其划分为25 个功能簇，在KEGG 数据库中比对注释了29 377个基因，可划分为5 个大类、19 个亚类代谢途径,据此筛选出八类植物激素信号转导相关的41 个基因家族；通过比对共得到43 102 个编码序列（coding sequence，CDS），平均长度749 bp, N50 为1 137；筛选到60 个转录因子transcript factor,TF）家族共1 502个转录因子基因；共发现17 195 个单核苷酸多态性（single-nucleotide polymorphism，SNP）位点，其中碱基转换11 122 个，颠换6 073 个；发现了8 245 个简单序列重复（simple sequence repeat，SSR），数量最多的为二核苷酸重复和三核苷酸重复。这些结果从功能和结构方面提供了阴地蕨整体转录组信息和涉及植物激素信号转导的潜在基因，为进一步深入研究阴地蕨的生长发育、遗传、品种鉴别等提供了分子生物学的基础数据。
分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2018-12-25 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 本试验旨在通过16S rRNA测序技术，分析奶牛体外发酵瘤胃微生物区系随时间推移的变化规律，为探究瘤胃微生物繁殖规律及完善体外发酵分析方法提供支持。试验使用体外产气法进行发酵。采集3头健康奶牛的新鲜瘤胃液，与人工唾液混合后，注入盛有发酵底物的发酵瓶，39 ℃水浴振荡培养，分别于0、6、12、24、48 h采集发酵液，用16S rRNA测序技术分析瘤胃细菌变化规律。结果表明：1）所有的序列被鉴定为14个门和59个属。随着时间的变化，在门水平上，纤维杆菌门（Fibrobacteres）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和黏胶球形菌门（Lentisphaerae）的相对丰度减少，纤维杆菌门、拟杆菌门在48 h时显著低于其他时间点（P<0.05），黏胶球形菌门在24 h时显著低于其他时间点（P<0.05）。而螺旋体门（Spirochaetae）和变形菌门（Proteobacteria）的相对丰度增加，螺旋体门在48 h时显著高于其他时间点（P<0.05），变形菌门在12、24、48 h时显著高于其他时间点（P<0.05）；随着时间的变化，在属水平上，丁酸弧菌属（Butyrivibrio）和瘤胃球菌属（Ruminococcus）的相对丰度增加，均在在48 h时显著高于其他时间点（P<0.05）；而解琥珀酸菌属（Succiniclasticum）和普雷沃氏菌属（Prevotella）的相对丰度则减少，解琥珀酸菌属在24、48 h显著低于其他时间点（P<0.05），普雷沃氏菌属在48 h时显著低于其他时间点（P<0.05）。2）试验获得15 792个操作分类单位（OTU）并进行多样性分析，稀释曲线达到平台期；Simpson指数和Shannon指数均表明菌群丰度具有先降低后升高的趋势。综上所述，奶牛瘤胃体外发酵过程中，瘤胃细菌主要的门以及属的相对丰度以及多样性均随时间推移发生改变，且因瘤胃细菌功能差异在发酵过程的变化更为显著。因此，在使用体外发酵法进行研究时，应充分考虑瘤胃细菌的功能差异与底物以及人工唾液的营养物质减少引起的发酵环境变化的关系。
分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-11-07 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 采食量是影响肉鸡健康生长的重要因素，摄入的营养物质除一部分用于维持肉鸡基本生命代谢需求外，大部分用于保障肉鸡良好的生长性能。下丘脑作为中枢神经系统调节采食量的重要部位，它可以整合外周环境和各种信号分子，使得机体做出适当的反应，最终调节肉鸡的采食量。温热环境因子是实际生产中影响家禽采食行为和生长性能的重要环境因素，本文就温热环境因子对肉鸡采食行为的影响、下丘脑的摄食信号整合机制以及关键热信号分子的调控机制作一综述，以期为肉鸡温热环境控制提供理论依据。
分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-11-07 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 温热环境是影响家禽生产的一个重要因素。肉鸡对温度的影响十分敏感，而湿度又常与温度共同作用影响肉鸡的体温调节。本文综述了环境温湿度对肉鸡生长性能、神经内分泌机能以及糖、脂类、蛋白质和矿物质代谢的影响及调控机制，以期为肉鸡温热环境控制提供理论依据。
分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-10-10 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要： 本试验旨在研究饲粮添加万寿菊提取物对肉鸡血清生化指标、抗氧化能力和免疫性能的影响。选取1日龄爱拔益加（AA）肉鸡192只，随机分为3组，每组8个重复，每个重复8只鸡。对照组饲喂基础饲粮，试验组在基础饲粮中分别添加0.15%和0.60%的万寿菊提取物，即有效成分叶黄素含量分别为30和120 mg/kg，试验期42 d。结果表明：与对照组相比，1）饲粮添加0.60%万寿菊提取物使肉鸡血清甘油三酯和低密度脂蛋白胆固醇水平显著降低（P0.05）。综上，肉鸡饲粮中添加万寿菊提取物可以提高肉鸡机体的抗氧化能力和免疫性能，且对机体脂代谢有调节作用。
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