分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-02-14 合作期刊: 《广西植物》
摘要: 太行菊(Opisthopappus taihangensis)、长裂太行菊(Opisthopappus longilobus), 为太行山特有多年生崖壁草本植物,菊科(Compositae)重要野生资源,具有较高的经 济与生态价值。为确定适合两物种的全基因组测序策略,本研究利用流式细胞法和高通 量测序技术,分析两物种基因组大小、杂合率、重复序列及GC 含量等信息。结果表明: (1)流式细胞法估算太行菊基因组大小为2.1 Gb,长裂太行菊基因组大小2.4 Gb;(2) 高通量测序修正后太行菊基因组大小为3.13 Gb,重复序列比例为84.35 %,杂合度为 0.99 %,GC 含量为36.56 %;长裂太行菊基因组为3.18 Gb,重复序列比例为83.83 %, 杂合度为1.17 %,GC 含量为36.62 %;(3)初步组装后GC 含量分布及平均深度存在 异常,出现分层现象,可能是两物种基因组杂合率较高所致。从基因组结构看,太行菊、 长裂太行菊均属于高重复、高杂合、大基因组的复杂基因组,建议使用Illumina + PacBio 测序组装策略,进行全基因组测序分析。
分类: 生物学 >> 动物学 提交时间: 2017-10-11 合作期刊: 《动物营养学报》
摘要: 肠道既是机体营养物质消化吸收的主要场所,也是防御肠道微生物感染的先天性屏障,肠道健康是机体正常生长发育的关键。微小RNA(miRNAs)是基因转录后调控的重要因子。本文主要对肠道miRNAs表达情况,miRNAs在肠道细胞中的增殖、分化、凋亡,miRNAs在营养代谢、肠道屏障功能、肠道相关疾病进程调控中的作用以及肠道对外源miRNAs摄取等方面的研究进行综述,以期为相关研究的开展提供参考。