贵州九种猕猴桃属植物叶绿体基因组特征及比较分析
后印本
Chloroplast genome features and comparative analysis of nine Actinidia species in Guizhou
摘要: 为明确猕猴桃属植物叶绿体基因组特征与系统发育关系，该文以贵州地区葛枣、革叶、京梨等9种猕猴桃为研究对象，基于二代测序数据开展叶绿体基因组组装、注释和比较基因组学分析，系统解析了其基因组特征与系统发育关系。结果表明：（1）9种猕猴桃属植物的叶绿体基因组均为双链环状分子，呈现典型的四分体环状结构，序列全长为155660~156770bp，总GC含量为37.21%~37.33%，基因组大小相似度较高。（2）注释得到130个基因，包括83个蛋白质编码基因、39个tRNA基因与8个rRNA基因，而黄毛与条叶猕猴桃仅注释到129个基因。（3）密码子使用偏好性相近，第三位碱基以A/U结尾为主；共鉴定出491个SSR位点，涵盖单核苷酸至六核苷酸6种重复类型。（4）比较基因组分析显示，LSC与SSC区序列变异高于IR区，非编码区变异较编码区更显著，共识别出9个突变基因片段，包括rps16-trnQ-UUG、ndhC-trnV-UAC和rbcL-accD等基因间隔区与基因区段。（5）系统发育树分为4支，葛枣猕猴桃遗传距离较远，中华与美味猕猴桃聚为一支，京梨、革叶、条叶和黄毛猕猴桃聚集为一支，阔叶与毛花猕猴桃亲缘关系最近。该研究为贵州省猕猴桃种质资源的鉴定与保护提供了叶绿体基因组层面的重要依据，也为该属植物的分类与系统进化研究积累了关键数据基础，从而为猕猴桃属植物的分子鉴定及相关系统发育研究奠定了理论基础。
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2026-05-22 19:17:11 |
ChinaXiv:202605.00207V1
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