大豆 GeBP 转录因子基因家族的生物信息学分析

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-04-29 合作期刊: 《广西植物》

巩元勇 赵丽华 闫 飞 朱丽红

摘要： GeBP 转录因子调控植物表皮毛的生长发育，并且参与控制植物叶片的发育。利用生 物信息学方法，在大豆全基因组范围内搜索 GeBP 基因家族，并从氨基酸理化性质、基因结 构、染色体的物理分布、系统进化、序列比对、功能结构域、组织表达情况等基本特征方面 对 GmGeBP 基因家族进行分析。共获得 9 个 GmGeBP 转录因子家族基因成员，其中仅 2 个 基因含有内含子，而且都只有 1 个内含子，表明该家族成员基因构造比较简单但稳定。 GmGeBP 编码的蛋白分子量为 39.65～49.24 kD，理论等电点为 4.65～9.08；这些成员基本上 都是酸性氨基酸，属于亲水性、不稳定蛋白。这 9 个基因不均匀的分布于 7 条染色体上，10 和 20 号染色体上分别分布 2 个 GeBP 基因，3、5、13、15、19 号染色体上各分布 1 个 基因。系统进化分析表明，大豆与拟南芥对应的 GeBP 成员亲缘关系较近，分别聚类到 4 个 分支，而与水稻的距离较远。结构域分析表明，9 个 GmGeBP 成员都包含 DUF573 结构域， 推测该部分在 GeBP 转录因子中很可能是与靶标基因顺式作用元件互作的结构域。通过分析 大豆 GmGeBP 转录因子家族基因的组织表达，发现不同基因的在大豆不同组织的表达量不 同，具有一定的特异性。该文对大豆 GeBP 转录因子基因家族的分析和鉴定为进一步研究大 豆表皮毛发育的分子作用提供了理论基础。

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