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  • 垫状卷柏SpLEA1基因克隆及干旱胁迫下的表达分析

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-03-30 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 晚期胚胎发育丰富蛋白(late embryogenesis abundant,LEA)与植物抗逆性密切相关,在干旱胁迫下保护植物细胞,减少植物损伤,并广泛存在于生物体内。垫状卷柏(Selaginella pulvinata)是一种在干旱胁迫下生存能力极强的蕨类植物,具有很强的恢复能力。为探究垫状卷柏SpLEA1基因在耐旱植物中的分子机制与表达特征,该研究以高耐旱性植物垫状卷柏为实验材料,基于转录组测序结果,采用RT-PCR技术获得SpLEA1基因cDNA序列,采用HiTail-PCR技术获得启动子序列,利用生物信息学对序列进行了分析,采用qRT-PCR技术,分析了SpLEA1基因在干旱胁迫下的表达模式。结果表明:(1)垫状卷柏SpLEA1全长为476 bp,开放阅读框(ORF)为279 bp,共编码92个氨基酸,通过在线工具预测到蛋白分子量为9 491.46 Da, 等电点为5.45,蛋白结构预测分析表明该蛋白为亲水性蛋白,含有10个磷酸化位点,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。(2)预测到SpLEA1蛋白的保守结构域为Lea-5,来源于LEA1家族,基于系统发生树和遗传距离矩阵,发现垫状卷柏SpLEA1与来自鹰嘴豆(Cicer arietinum )和红三叶(Trifolium pratense)的Lea-5蛋白同源性较高。(3)利用在线工具对启动子序列进行顺式作用元件的预测分析发现SpLEA1基因启动子含有5类激素响应元件和与干旱胁迫响应有关的功能元件。(4)在自然干旱处理下SpLEA1基因表达上调并在12 h时达到峰值,在24 h干旱后进行复水处理,表达量显著下调。综上所述,SpLEA1基因在垫状卷柏中很可能参与了干旱胁迫响应机制的相关调控。此结果为进一步研究垫状卷柏SpLEA1基因在干旱胁迫下的功能及其表达调控机制奠定了基础。

  • 纤枝短月藓 BeLEA2 基因的克隆及表达分析

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2020-09-15 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 为探究纤枝短月藓􀀁LEA2 基因的结构和表达特征,该研究以纤枝短月藓为材料,首次利用􀀁PCR 克隆技术得到纤枝短月藓􀀁BeLEA2 基因序列,对该基因进行分析。结果表明:该基因序列中含有􀀁2 个外显子和􀀁1 个内含子,其开放阅读框(ORF)为 456 bp,编码􀀁151 个氨基酸,预测其相对分子质量为􀀁16 515.96 Da。将纤枝短月藓与其他植物􀀁LEA2 基因氨基酸序列进行比对,构建系统进化树,结果显示纤枝短月藓与小立碗藓的亲缘关系最近。利用HiTail PCR 技术克隆获得􀀁1 072 bp 的􀀁BeLEA2 启动子序列,用􀀁PlantCARE 在线工具对该启动子的顺式作用元件进行预测,结果表明该启动子除了含有核心启动子元件􀀁TATA-box 和CAAT-box 外,还含有􀀁ABRE、MYB、MYC、MYB 结合位点(MBS)等其他顺式元件。实时荧光定量􀀁PCR 分析表明,BeLEA2 基因在纤枝短月藓不同发育时期和不同组织中都有表达,且对脱水胁迫有响应。以上结果为进一步探究􀀁LEA2 基因在苔藓植物中的功能及作用机制奠定了基础。