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1. chinaXiv:202010.00049 [pdf]

紫花苜蓿叶绿体基因组密码子偏好性分析

喻凤; 韩明
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

为了理解紫花苜蓿叶绿体基因组密码子偏好性的使用模式,该文以紫花苜蓿叶绿体基因组中筛选到的49条蛋白质编码序列为研究对象,利用CodonW、CUSP、CHIPS、SPSS等软件对其密码子的使用模式和偏好性进行分析。结果表明:紫花苜蓿叶绿体基因的第3位密码子的平均GC含量为26.87%,有效密码子数(ENC)在40.6~51.41之间,多数密码子的偏好性较弱。相对同义密码子使用度(RSCU)分析发现,RSCU>1 的密码子数目有30个,以A、U结尾的有29个,说明了紫花苜蓿叶绿体基因组A或U出现的频率较高。中性分析发现,GC3与GC12的相关性不显著,表明密码子偏性主要受到自然选择的影响;而ENC-plot 分析发现一部分基因落在曲线的下方及周围,表明突变也影响了部分密码子偏性的形成。此外,有17个密码子被鉴定为紫花苜蓿叶绿体基因组的最优密码子。紫花苜蓿叶绿体基因组的密码子使用的偏好性可能受到自然选择和突变的共同作用。该研究将为紫花苜蓿叶绿体基因工程的开展和目标性状的遗传改良奠定基础。

submitted time 2020-10-20 From cooperative journals:《广西植物》 Hits4959Downloads310 Comment 0

2. chinaXiv:201803.00489 [pdf]

内源CD133+细胞示踪小鼠模型的制备和鉴定

韩明; 罗玉萍
Subjects: Biology >> Bioengineering

本研究旨在制备可追踪CD133阳性神经干细胞分化谱系的小鼠模型。将两种C57B16背景的转基因小鼠CD133-Cre-ERT2和Rosa26-CAG-LSL-ZsGreen杂交,获得CD133-CreER;CAG-ZsGreen小鼠模型。免疫组化和激光扫描共焦成像分析表明,经Tamoxifen作用后,该杂交小鼠在侧脑室SVZ区、第三脑室和第四脑室的室管膜区域均表达绿色荧光蛋白ZsGreen,且这些区域的绿色荧光与CD133+红色荧光重合。在室管膜区CD133+是静息态神经干细胞的标志,因此,通过分析CD133-CreER;CAG-ZsGreen小鼠中的 ZsGreen阳性细胞可追踪神经干细胞的细胞分化谱系。本研究成功制备了内源CD133+细胞示踪小鼠模型,为探讨大脑中CD133+神经干细胞的激活、增殖、迁移和分化提供了帮助。

submitted time 2018-03-13 From cooperative journals:《中国生物工程杂志》 Hits1736Downloads679 Comment 0

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