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  • 椰子脂肪酸积累及与FatB 基因表达关系研究

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2020-03-06 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 分别对椰子果实发育四个时期的脂肪酸成分及含量变化,FatB 基因的表达变化进行分析,明确椰子脂肪酸积累及FatB 基因表达量变化之间的关系,为将来筛选控制椰子果实中低碳链脂肪酸积累的关键FatB 基因奠定基础。以海南本地高种绿椰为试验材料,参考国家标准GB/T 2906-1982 谷类、油料作物种子粗脂肪测定方法,用索氏提取法提取果肉脂肪酸,应用气质联用检测技术测定各脂肪酸含量及组分。应用qRT-PCR 对椰子脂肪酸合成相关基因FatB1、FatB2 及FatB3 进行相对定量。分析椰子果实发育四个时期脂肪酸组分及含量、脂肪酸合成相关基因FatB1、FatB2 及FatB3 表达量之间的变化趋势。结果表明:椰子油含9 种脂肪酸成分,在椰子果实发育的早期(第6、第7 个月),棕榈酸、硬脂酸和油酸的含量较高,月桂酸和肉豆蔻酸相对含量较低,通过实时荧光定量PCR 发现,此时FatB1基因的相对表达量较高。而在椰子果实发育的后期(第8、第9 个月),棕榈酸、硬脂酸和油酸的相对含量迅速降低,月桂酸和肉豆蔻酸相对含量迅速升高,FatB2 和FatB3 基因的相对表达量较高,FatB1的表达量略有降低。该研究初步掌握了椰果各发育时期FatB 基因表达量与脂肪酸成分间的变化趋势,该结果为将来筛选控制椰子果实中低碳链脂肪酸积累的关键FatB 基因奠定基础,同时为椰子脂肪酸成分的分子改良提供理论依据

  • 油棕WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2019-08-27 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 该研究从NCBI网站下载油棕全基因组序列信息,从Arabidopsis Information Resource(TAIR)数据库中下载得到拟南芥WRKY转录因子序列,并在油棕基因组数据库中进行BLAST同源序列比对分析,通过NCBI在线工具CDD和PFAM数据库进行蛋白结构与分析,剔除无WRKY结构域的系列,利用生物信息学方法对油棕WRKY转录因子进行分析及功能预测。结果表明:从油棕基因组数据库中发掘WRKY转录因子95个,该WRKY转录因子蛋白质所编码氨基酸大小为116~1 303 bp,95个均为亲水性蛋白,总体为不稳定蛋白(EgWRKY25和EgWRKY56除外),60个蛋白以α-螺旋为主要二级结构元件,35个以无规卷曲为主要二级结构元件。保守结构域系统进化树结果表明,油棕WRKY转录因子家族蛋白主要分为三大类(I、II和III),I类分为IC和IN亚类,II类分为II a、II b、II c和II d亚类。内含子和外显子结构结果表明,EgWRKY基因结构进化高度保守。该研究结果对油棕WRKY转录因子的挖掘、功能分析及分子生物学研究奠定了基础,此外,还对分子育种和遗传改良提供参考。