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Your conditions: Applied botany(438)

1. chinaXiv:202104.00064 [pdf]

泛基因组研究在遗传多样性和功能基因组学中的应用

向坤莉; 贺文闯; 邹益; 彭丹; 张晓妮; 廖雪竹; 王杰; 杨健康; 武志强
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

相对于单个参考基因组仅聚焦于个体遗传信息的挖掘,泛基因组研究则能够反映整个物种或类群全部的遗传信息。随着基因组测序和分析技术的不断发展,泛基因组学逐渐成为新的研究热点,并已在植物、动物和微生物多个物种中获得了广泛应用,为全面解析物种或类群水平的遗传变异和多样性、功能基因组和系统进化重建等研究提供了强有力的工具,取得了很多显著的研究成果。尽管如此,由于泛基因组学研究尚处于发展阶段,测序费用和分析成本仍然较高,难以广泛普及;且存在分析标准不一、数据挖掘不够全面深入、理论难以应用于生产实际等尚待解决的问题,仍有较大的发展空间。该文系统总结了泛基因组在生物遗传多样性挖掘和功能基因组学中的研究进展,主要包括其在泛基因组图谱的构建、基因组变异和有利基因的发掘、功能基因的多态性、群体遗传多样性和系统进化等多个领域中的应用和研究,探讨了其在不同领域的应用潜力。同时,讨论了目前泛基因组研究中存在的局限性和可能的解决方法,并对其将来的发展前景进行了展望。

submitted time 2021-04-13 From cooperative journals:《广西植物》 Hits12Downloads3 Comment 0

2. chinaXiv:202104.00008 [pdf]

桂林岩溶石山落叶阔叶林种类组成及其环境解释

林红玲; 梁士楚; 姚义鹏; 姜勇; 包含; 农彩汪; 宋静; 黄佳; 甘鑫梅
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

落叶阔叶林是亚热带岩溶石山典型的森林植被类型之一,为了了解此类森林植被的群落类型和组成结构,本研究在桂林阳朔县和灵川县岩溶生境典型的落叶阔叶林内设置了 49 个 20 m× 20 m 的随机样方,在野外调查的基础上进行群落数量分类和排序,对其群落类型进行划分。在此基础上对不同类型的群落种类组成、结构及其分布与环境因子的耦合关系进行深入分析。结果表明:(1)桂林岩溶石山落叶阔叶林可划分 3 个群丛组类型,即群丛组 A:南酸枣-喜树+巴豆群丛组(ASS. Choerospondias axillaris-Camptotheca acuminata+Croton tiglium),群丛组 B:光皮梾木-喜树群丛组(ASS. Swida wilsoniana-Camptotheca acuminata),群丛组 C:麻栎-檵木群丛组(ASS. Quercus acutissima-Loropetalum chinense)。(2)不同群落类型中常绿和落叶物种的丰富度、多度、胸高断面积及重要值的变化:在乔木层中,3 个群丛组均为落叶物种占优势;在灌木层中,群丛组 A、B 以落叶物种占优势,群丛组 C 以常绿物种占优势。(3)在 1~5 cm 和5~10 cm 径级内,群丛组 A 和 B 的落叶物种在 4 个度量指标上均大于常绿物种,群丛组 C 除了物种丰富度以外,均为常绿物种大于落叶物种;在 ≥10 cm 径级中,除了群丛组 B 的物种丰富度外,3 个群丛组中的各项指标均为落叶物种占主导地位。(4)岩石裸露率、海拔、坡向、土壤含水量、土壤 pH、土壤有机质、全氮、速效氮、速效钾、林冠开阔度和人为干扰是影响研究区不同类型群落分布的主要环境因子。

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3. chinaXiv:202104.00009 [pdf]

中国仙人掌科一新归化种——匍地仙人掌

王琦; 严靖
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

在进行多肉植物资源调查时,在我国山东发现一仙人掌科仙人掌属新记录种——匍地仙人掌[Opuntia humifusa (Raf.) Raf.]。该种具有独特的匍匐生长习性,叶状茎深绿色,无白霜,无针状刺,花黄色,与国内分布的仙人掌属其他物种区别明显。匍地仙人掌原产于北美洲,是仙人掌科为数不多的耐寒种类之一,现归化于中国山东省日照市五莲县,系目前发现的在我国野外分布最北的仙人掌科植物。该种可能于? 20 世纪? 50 年代在国家推广中药材时期引入种植,人类活动致使其种群逐渐扩散。同时,对匍地仙人掌与江苏报道的二色仙人掌之间的分类学问题进行了论述,并对将来匍地仙人掌在我国暖温带地区合理的开发利用进行了展望。

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4. chinaXiv:202104.00010 [pdf]

桂北岩溶区与非岩溶区植物叶片含水率高光谱反演

秦佳双; 顾大形; 倪隆康; 何文; 阮杨春; 黄玉清; 王权
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

叶片水分状况是反映植被生理状况的重要指标,构建高普适性的植物叶片含水率高光谱反演模型对准确评价岩溶和非岩溶植被生态功能具有重要意义。以我国西南典型区域内岩溶区与非岩溶区共 17 种植物 694 个样品为研究对象,同步测量叶片含水率和反射光谱,采用单波段、差值型、比值型、归一化型等四类光谱指数模型,对反射光谱及一阶导数光谱进行全波段搜索分析。结果表明:光谱指数 D 2048 -D 1733 的建模与验证结果均最好,为岩溶植物叶 片 含 水 率 的 最 佳 估 计 光 谱 指 数 ; 对 于 非 岩 溶 植 物 , 光 谱 指 数 D 2356 /D 1885 和(D 2356 -D 1885 )/(D 2356 +D 1885 )建模与验证结果均相差很小,均可作为叶片含水率最佳估计模型;该研究结果还表明叶片绒毛对岩溶植物叶片含水率反演光谱指数构建影响不大。总体上,新构建的最优光谱指数对岩溶区与非岩溶区植物叶片含水率的拟合效果优于传统指数,具有较好的普适性,可为精准评估桂北地区植被水分状态提供科学依据。

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5. chinaXiv:202104.00011 [pdf]

黄花倒水莲生长与内源激素水平动态变化关系研究

张玉仙; 唐 辉; 黄夕洋; 刘宝玉; 李文兰
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

为探索黄花倒水莲春梢生理生化特性的差异以及不同内源激素的变化规律,该文对黄花倒水莲春梢的生长动态进行监测,采用间接酶联免疫吸附法(ELISA)测定脱落酸(ABA)、生长素(IAA)、赤霉素(GA)、乙烯(ETH)和玉米素核苷(ZR)五种内源激素含量的动态变化,并对两者间的相关性进行分析。结果表明:黄花倒水莲春梢生长发育过程可分为快速增长期(0~12 d)、生长转折期(16~20 d)和缓慢增长期(24~32 d)三个阶段。内源激素 ABA、GA、ETH 和 ZR 含量在缓慢增长期显著高于快速增长期和生长转折期,IAA 含量各时期差异较小。相关性研究结果发现,春梢长、底部叶长和叶宽在快速增长期与 ABA、GA、ETH 和 ZR 含量呈负相关,且与 ZR 含量具有一定显著性,与 IAA 含量呈正相关;生长转折期,各指标与 GA、ETH 和 ZR 含量呈正相关,与 GA 含量具有一定显著性,与 ABA 含量呈负相关;缓慢增长期,各指标与五种内源激素含量均呈正相关,与IAA 和 ZR 含量具有一定显著性。该研究结果为生产上利用外源激素调控黄花倒水莲春梢抽出以及生长提供了理论基础。

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6. chinaXiv:202104.00012 [pdf]

黄褐毛忍冬生药学鉴定研究

蒋向辉; 肖龙骞; 杨永平
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

黄褐毛忍冬具有消炎、抗菌、免疫调节等多种功效,但容易与忍冬属其他物种混淆,通过生药学研究将为黄褐毛忍冬的鉴定工作和药材标准的制定提供科学依据。该文采用植物学鉴定、显微镜观察、薄层色谱鉴定和分子鉴定的方法从植物学性状、药材显微特征、薄层色谱和 ITS(internal transcribed spacer)序列特征等方面对黄褐毛忍冬进行了专属性特征鉴定。结果表明:(1)黄褐毛忍冬花朵横切面分泌细胞较多,花瓣外表面有黄褐色腺毛;花冠表皮上层细胞为多角形,蚌形花粉囊对开,花粉粒形状规则,有三角形和卵圆形两种,油室椭圆形。(2)粉末显微检测发现中柱鞘纤维呈短棱形;木栓细胞棱角明显,呈浅黄色;木纤维呈粗短的棱形,偶见有弯曲;网纹导管较多,细胞腔密布草酸钙方晶。(3)薄层色谱显示黄褐毛忍冬花中三柰酚含量较高,三柰酚可作为黄褐毛忍冬的检视成分。(4)基于 ITS 序列系统聚类结果显示,ITS 序列可以作为 DNA 条形码将黄褐毛忍冬、灰毡毛忍冬、华南忍冬和金银花准确地区分。上述结果表明黄褐毛忍冬生药学特征明显,本研究为黄褐毛忍冬药材鉴定、成分分析和质量标准制定提供了参考。

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7. chinaXiv:202104.00013 [pdf]

葡萄 CBF4 生物信息学及对低温和硅酸钾响应分析

张红梅; 王旺田; 张芮; 杨科; 王宝强; 王翠玲
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

为探究葡萄 CBF4 基因的结构和表达特征,该研究以葡萄为材料,对葡萄 CBF4 基因进行生物信息学及低温和硅酸钾响应分析。结果表明:CBF4 蛋白定位在细胞核,有 5 个磷酸化位点和 14个糖基化位点,无信号肽,是一个亲水的、脂溶性较差的膜外蛋白。二级结构以无规则卷曲为主,比例为 56.88%。该蛋白包含一个 AP2/EREBP 结构域。CBF4 蛋白的多序列和系统进化分析表明酿酒葡萄与美洲葡萄的同源性最高、亲缘关系最近。荧光定量 PCR 分析显示,低温胁迫后 CBF4 基因在葡萄叶片中表达水平上调,说明 CBF4 基因可能参与了葡萄叶片低温胁迫的响应。低温条件下,施加硅酸钾 CBF4 基因表达具有差异性,说明该基因在不同的葡萄组织中对硅酸钾的响应机制可能不同。以上结果为进一步研究葡萄 CBF4 基因的功能和机理奠定了基础。

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8. chinaXiv:202104.00014 [pdf]

不同生境三种杜鹃属植物花特征比较

胡德美; 董溪; 吴江明; 胡莲宇; 唐明; 王晓月
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

生境影响植物花部特征的分化。为探究不同人为干扰强度生境是否影响杜鹃花特征分化和资源分配,以及不同颜色杜鹃花分布情况。本研究以百里杜鹃保护区高、中、低人为干扰强度生境的马缨杜鹃、迷人杜鹃和露珠杜鹃为实验材料,采用五点取样法统计不同生境杜鹃花的植株数量,游标卡尺测量花部特征,光学显微镜统计花粉数,海洋光谱仪测定花色的反射光谱,Gephi 软件绘制植株数量的网络图。结果表明:(1)迷人杜鹃植株数量显著多于马缨杜鹃和露珠杜鹃。(2)低强度干扰生境中马缨杜鹃的营养器官和繁殖器官特征指数大于高、中强度生境;不同干扰强度生境对迷人杜鹃花部特征的影响不明显;中、低干扰强度生境露珠杜鹃的营养器官和繁殖器官特征指数显著高于高强度干扰生境。(3)马缨杜鹃和迷人杜鹃的花色在 400~500 nm 波长有较高的反射,而露珠杜鹃的花色在 400~700 nm 波长有较高的反射。(4)在高、中等强度干扰生境中迷人杜鹃与其他两种杜鹃花都分布紧密,在低强度干扰生境中马缨杜鹃和迷人杜鹃分布更紧密。该研究对杜鹃花的种群管理和生物多样性保护提供重要的理论基础。

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9. chinaXiv:202104.00016 [pdf]

不同处理对桢楠和浙江楠裸根移栽成活率与生理特性的影响

朱司甲; 黄扬; 郑文俊
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

为了探究保水剂和 ABT 联合处理后对桢楠(ZN)和浙江楠(ZJN)裸根苗移栽成活率和生理特性的影响,该文使用三种不同浓度的保水剂和 ABT 联合处理 ZN 和 ZJN 裸根苗,测定移栽后的幼苗成活率和生理指标,并对各指标进行综合评价,评估不同条件处理下幼苗恢复情况。结果表明:与对照组相比,联合处理后,ZN 和 ZJN 的成活率显著提高;ZN新叶数量显著增加,ZJN 的新叶数量没有增加;叶绿素和类胡萝卜素含量均显著提高,且ZN1 或ZJN1 水平更显著;(GA 3 +ZR+IAA)/ABA 和 IAA/ABA 的比值均显著提高,但 ZN 在不同浓度处理间无显著差异,而 ZJN1 显著高于 ZJN2 处理组;可溶性蛋白和可溶性糖的含量均减少。隶 属 函 数 综 合 评 价 分 析 表 明 裸 根 苗 移 栽 成 活 率 的 表 现 分 别 为 ZN1>ZN2>CK 和ZJN1>ZJN2>CK。总之,保水剂和 ABT 联合处理促进 ZN 和 ZJN 裸根苗移栽成活,且 ZN1 或ZJN1 水平更优。

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10. chinaXiv:202104.00015 [pdf]

中国兰科二新记录种

李孟凯; 陈学达; 夏晨曦; 邢震; 罗艳
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

兰科植物资源调查是掌握地区兰科本底资料的基础,对研究兰科植物的地理分布和资源多样性具有重要意义。该文报道了分别产自中国西藏自治区墨脱县和巴宜区的石豆兰属(Bulbophyllum Thou.)中国分布新记录种——尼泊尔大苞兰(B. raskotii J. J. Verm., Schuit. &de Vogel)和曲唇兰属[Panisea (Lindl.) Steud.]中国分布新记录种——林芝曲唇兰(P.panchaseensis Subedi)。两个新记录种生长在海拔约 2 000 m 的常绿阔叶林中的树干或岩壁上。该文提供了二新记录种的形态特征描述和彩色图片等信息,附有国产曲唇兰属的分种检索表。该研究扩充了我国兰科植物的记录,为我国兰科植物多样性和保护研究提供了新资料。

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