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1. chinaXiv:202008.00053 [pdf]

小立碗藓LysM 型类受体激酶基因家族生物信息学分析

高梅; 辛健康; 姜山
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

植物 LysM 型类受体激酶(lysin motif receptor-like kinase,LYKs)是植物中发现的一类重要的 RLK,在植物生长发育、抵御逆境胁迫等方面具有不可忽视的作用,是植物中基因功能的研究热点。为更好地了解小立碗藓中的 LYK 基因,该文利用生物信息学的方法对小立碗藓(Physcomitrella patens)LysM 型类受体激酶基因家族成员进行鉴定及分析。通过分析小立碗藓 LYK 家族成员的基本物理信息、基因结构、染色体定位及系统发生关系,初步探讨了其 LYK 基因结构、进化与功能间的联系。结果表明:小立碗藓中共有 21个 LYK 基因,其氨基酸序列大小在 625~755 aa 之间,分子量范围为 69.54~82.02 kDa,等电点在 5.98~7.78之间。将小立碗藓所有 LYK 蛋白与 3 种典型模式植物(水稻、拟南芥和蒺藜苜蓿)的 LYK 蛋白共同构建系统进化树,所有 LYK 蛋白被分为 4 个亚组(LYK-I、LYK-II、LYR-I 和 LYR- II)。小立碗藓各亚组内成员的基因结构、保守域特征显示出较为相似的特征,由此推测其可能具有相同或相似的功能。染色体定位发现,21 个 LYK 基因集中分布于 4 条染色体上并出现小型基因簇,这可能同样与基因功能相联系。该文分析了小立碗藓 LysM 型类受体蛋白激酶基因家族的基本信息,可为后续深入研究其 LYK 基因家族成员的生理生化功能奠定基础。

submitted time 2020-08-03 From cooperative journals:《广西植物》 Hits2136Downloads227 Comment 0

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