金华猪和长白猪粪便微生物移植小鼠的肠道古菌结构分析

分类： 生物学 >> 动物学 提交时间： 2017-10-23 合作期刊: 《动物营养学报》

杨华 王军军 李天天 唐标 何祥祥 李开锋 肖英平

摘要： 本试验旨在比较肥胖型的金华猪和瘦肉型的长白猪肠道古菌结构差异，分析菌群移植小鼠肠道古菌结构。采集金华猪和长白猪的新鲜粪便，通过灌胃移植到经广谱抗生素处理过的小鼠肠道中，提取2种猪粪便及其移植小鼠的盲肠内容物总基因组DNA，使用古菌通用引物对古菌16S rRNA的V4区进行PCR扩增，通过Illumina Hiseq测序平台对扩增产物进行高通量测序，使用QIIME等软件对测序序列进行分析统计。结果表明：金华猪和长白猪粪便及其移植小鼠盲肠内容物中的古菌主要包含3个门，分别为奇古菌门（Thaumarchaeota）、广古菌门（Euryarchaeota）和泉古菌门（Crenarchaeota），其中金华猪粪便中广古菌门的丰度高于长白猪；在属水平上主要包含5个已知属，优势属为餐古菌属（Cenarchaeum）。二者移植小鼠的盲肠内容物古菌结构，在门水平上，移植小鼠的奇古菌门比例占70%以上；奇古菌门的古菌几乎全部来源于餐古菌属；在门和属的水平上，金华猪和长白猪粪便移植小鼠的盲肠古菌结构无显著差异（P>0.05），但基于操作分类单元（OTU）水平的主成分分析显示出很好的组内聚集。由此可见，奇古菌门的餐古菌属是金华猪和长白猪粪便和其移植小鼠盲肠中的优势古菌；金华猪粪便中广古菌门的丰度高于长白猪粪便，且二者移植小鼠盲肠内容物之间古菌结构在OTU水平上存在一定的差异。

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