分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-05-28 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 钙依赖型蛋白激酶(calcium-dependent protein kinases, CDPKs)是高等植物细胞中重要的钙离子信号受体，在植物抵御逆境胁迫过程中发挥着重要作用。本研究以地黄为材料，设计特异引物，克隆地黄RgCDPK基因全长序列，并使用在线软件进行生物信息学分析，采用荧光定量PCR技术进行组织特异性分析。结果表明：（1）克隆得到的地黄CDPK基因长度为1 770 bp，编码个589个氨基酸；（2）多序列比对和结构分析显示，该蛋白含有钙依赖蛋白激酶典型结构域丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶区及EF-手性区.系统进化分析表明其与拟南芥 AtCDPK28 的同源关系最近，因此命名为RgCDPK(Genbank登录号为MT024235)；（3）组织特异性分析得出RgCDPK在地黄叶中表达量最高。本研究成功克隆出地黄CDPK基因，且发现该基因在不同组织中的表达存在差异，为以后深入研究CDPK在地黄连作障碍等生物及非生物胁迫中的分子机制提供理论基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2019-08-27 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为探究夏枯草中GGPPS基因的生物学特性及功能，本实验在夏枯草转录组测序的基础上设计特异性引物，采用逆转录 PCR 技术获得夏枯草中GGPPS基因的全长核苷酸序列，并进行生物信息学分析；采用 qPCR 法分析PvGGPPS基因在不同外源性物质诱导下在夏枯草果穗中的表达量以及该基因在夏枯草不同组织中的表达量。结果表明：PvGGPPS 基因开放阅读框1 092 bp，编码363个氨基酸，理论分子量为38 815.68 D，等电点为5.69。PvGGPPS蛋白具有异戊烯基焦磷酸合酶家族的特征结构域。系统进化树表明PvGGPPS蛋白与丹参、毛喉鞘蕊花GGPPS蛋白具有较高的亲缘关系。qPCR分析表明，PvGGPPS基因在叶中表达量高于果穗及茎。对果穗施加7种外源性物质处理24 h后，GA3 处理组该基因表达量升高。PvGGPPS 基因在夏枯草不同组织中表达量差异较大，且受外源物质诱导表达。该研究结果为进一步研究PvGGPPS 基因对夏枯草萜类成分合成途径中的功能及表达调控奠定基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2019-02-25 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 在夏枯草转录组测序的基础上设计特异引物，采用逆转录PCR技术获得该基因的全长核苷酸序列，并进行生物信息学分析，采用qRT-PCR法分析PvDXS在夏枯草不同组织及不同外源性物质诱导下的表达量。克隆得到的PvDXS基因开放阅读框2181 bp，编码726个氨基酸，理论分子量为78 040.47 D，等电点为6.75,PvDXS 蛋白具有Transketolase_C 结构域和Transket_pyr 结构域，系统进化树结果表明，PvDXS 蛋白与丹参、长春花的DXS（SmDXS2、CrDXS2）亲缘关系较近，推测PvDXS 属于第II 类DXS 蛋白。qRT-PCR 分析表明，PvDXS 基因在叶中表达量高于果穗及茎。对果穗施加7种外源性物质处理24 h后，GA3处理组该基因表达量升高，其它6种外源性物质处理后表达量均降低，其中CaCl2、SNP、SA处理后该基因的表达量显著降低。PvDXS基因在不同组织中表达量差异较大，且受外源物质诱导表达，该研究结果为进一步研究PvDXR基因对夏枯草萜类成分合成途径中的功能及表达调控奠定基础
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