分类： 生物学 >> 生物化学 分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2024-01-25
摘要： 目的：通过分析小鼠自主食用不同甜味物质后尿液蛋白质组的变化，探索其对机体的可能影响。方法：收集C57BL/6l小鼠主动食用甜味物质前后的尿液样品。甜味物质包括目前世界范围内应用较为广泛且能引起小鼠喜好反应的蔗糖、甜菊糖苷、安赛蜜、三氯蔗糖，其中非营养性甜味剂的浓度选择了已有研究显示的小鼠喜好反应最强烈的浓度。通过高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术进行分析，成组筛选尿液蛋白质组的差异蛋白，进行蛋白质功能和生物学过程分析；进行单只小鼠食用甜味物质前后尿液蛋白质组比较；并将不同甜味物质进行横向对比。结果及结论：尿液蛋白质组可以反映小鼠自主食用甜味物质后的机体变化，且小鼠自主食用的不同甜味物质对尿液蛋白质组的影响并不相同。4种甜味物质中，三氯蔗糖与蔗糖引起机体的变化最为相似，甜菊糖苷与蔗糖引起机体的变化相差最远；蔗糖、安赛蜜和三氯蔗糖引起的机体变化相似，而甜菊糖苷引起机体的变化与其他甜味物质不同。小鼠自主食用4种甜味物质后尿液蛋白质组差异蛋白中均有已经被报道的与脑奖励回路相关的蛋白，而只有自主食用蔗糖、安赛蜜和三氯蔗糖后尿液蛋白质组差异蛋白大量与代谢过程相关，自主食用甜菊糖苷后尿液蛋白质组差异蛋白主要与核小体组装、基因表达等过程相关。
分类： 生物学 >> 生物化学 提交时间： 2024-01-20
摘要： 大鼠在闻气味时，其尿液蛋白质组是否有相应的变化呢？闻不同气味产生的变化会不同吗？本研究通过对6只大鼠闻香油、风油精3天后，第3天、第4天的尿液样本进行采集，并使用LC-MS/MS技术对样本进行成组及单只前后对比分析。同时将已鉴定到的差异蛋白与同年龄段大鼠生长发育产生的差异蛋白进行比较，以排除生长发育对本实验结果造成的影响。实验结果表明，将香油组Day0和Day4的尿蛋白质组相比较，经过筛选可以鉴定到143个差异蛋白，随机产生的差异蛋白平均为7.32个，至少有94.88%的差异蛋白不是随机产生的。经成组及单只前后比较分析，同一气味呈现出较为一致的变化，在香油组鉴定到了与嗅觉产生相关的低密度脂蛋白受体相关蛋白2、COPD的生物标志物胎球蛋白B等差异蛋白，同时在风油精组鉴定到子宫球蛋白、三叶草因子3、粘蛋白2等变化显著且与嗅觉产生相关的差异蛋白。值得一提的是，我们在风油精组再次鉴定到了气味结合蛋白2A，同时存在于4只大鼠单只前后比较产生的差异蛋白中，这与电子烟模型呈现的结果一致。本研究证明，气味会对大鼠的尿液蛋白质组产生影响，不同气味对其的影响不同。这为探究嗅觉的生物学过程提供了新方法。
分类： 生物学 >> 生物化学 提交时间： 2024-01-19
摘要： 锌是维持生物体正常生理功能所必需的元素。本研究对大鼠灌胃82mg/kgd葡萄糖酸锌（相当于锌剂量11.7mg/kgd）4天，对比分析了大鼠短期灌胃葡萄糖酸锌前后的尿液蛋白质组。许多差异蛋白被报道与锌有关，比如粘蛋白-2(MUC-2)(灌胃前是灌胃后的14倍，p=0.005)、转甲状腺素蛋白（Transthyretin）（灌胃后是灌胃前的3.9倍,p=0.0004）等。差异蛋白富集到的生物学过程（例如细胞凋亡过程的调控、免疫系统过程等）、分子功能（例如钙离子结合、铜离子结合、信号受体活性等）、KEGG通路（例如补体和凝血级联反应、PI3K-Akt信号通路等）显示出与锌的相关性。本研究从尿液蛋白质组学的角度探究锌对机体的整体影响，有助于深入理解锌的生物学功能，拓宽尿液蛋白质组学的应用潜力。
分类： 生物学 >> 生物化学 提交时间： 2024-01-18
摘要： 钙是维持生物体正常生理功能所必需的元素。本研究对大鼠灌胃葡萄糖酸钙3225mg/kgd（相当于钙剂量300mg/kgd）4天，对比分析了大鼠短期灌胃葡萄糖酸钙前后的尿液蛋白质组。许多差异蛋白被报道与钙有关，比如Regucalcin（灌胃后是灌胃前的2.6倍，p=0.022）、跨膜蛋白132A（Transmembrane protein 132A）（灌胃后是灌胃前的8.2倍，p=0.009）、肌酸激酶（creatine kinase）（灌胃前是灌胃后的17.5倍，p=0.006）、Claudin-3（灌胃前是灌胃后的13.3倍，p=0.037）等。差异蛋白富集到的KEGG通路包括钙信号通路，生物学过程和分子功能也显示出与钙的相关性。本研究从尿液蛋白质组学的角度探究钙元素对机体的整体影响，有助于深入理解钙元素的生物学功能，拓宽尿液蛋白质组学的应用潜力。
分类： 生物学 >> 神经生物学 提交时间： 2024-01-09
摘要： 电子游戏成瘾表现为对数字游戏的不断增长的热情和无节制的使用，但游戏成瘾无客观指标。本研究利用质谱蛋白质组学技术分析了沉迷游戏的青少年与不玩电子游戏的青少年尿液中的蛋白质组差异。共纳入10名沉迷游戏的青少年和9名不玩电子游戏的青少年作为对照组。结果显示，两组之间存在125种差异显著的蛋白质，其中有11个蛋白已被报道服用精神类药物后在体内发生变化，并与成瘾相关：Calmodulin、ATP synthase subunit alpha、ATP synthase subunit beta、Acid ceramidase、Tomoregulin-2、Calcitonin、Apolipoprotein E、Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase、Heat shock protein beta-1、CD63 antigen、Ephrin type-B receptor 4、Tomoregulin-2。另外有多个蛋白可以与成瘾相关的通路相互作用：Dickkopf-related protein 3、Nicastrin、Leucine-rich repeat neuronal protein 4 、Cerebellin-4。在富集到的生物学通路中发现一氧化氮合酶的相关通路、安非他命成瘾相关通路和许多钙离子通路等一些和成瘾相关的通路。同时，通过对差异表达蛋白的分析，我们推测了一些尚未被充分研究的蛋白质，这些蛋白质可能在成瘾机制中扮演着重要角色：Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein、、Cysteine-rich motor neuron 1 protein、Bone morphogenetic protein receptor type-2、Immunoglobulin superfamily member 8。 在对网络游戏成瘾青少年的尿液蛋白质进行分析时，我们发现了多种先前已在药物成瘾研究中被报道的蛋白质。
分类： 生物学 >> 生物化学 提交时间： 2024-01-04
摘要： 铁是维持生物体正常生理功能所必需的微量元素，还没有研究从尿液蛋白质组的角度探究铁元素对机体的整体影响。本研究对大鼠灌胃多糖铁复合物（28mg/kgd 铁元素，相当于成年人预防贫血的剂量）4天，采用自身前后比较和成组比较两种分析方法，对比分析了大鼠短期灌胃多糖铁复合物前后的尿液蛋白质组。许多差异蛋白被报道与铁有关，包括2'，3'-环核苷酸3'-磷酸二酯酶(CNPase)（灌胃前是灌胃后的7.7倍，p=0.0039）、p38（灌胃后是灌胃前的14.5倍，p=0.003）等；单只大鼠前后比较中，铁调素（Hepcidin）在4只大鼠中同时上调。差异蛋白富集到的生物学过程包括对碳水化合物代谢过程、铁离子的反应、细胞凋亡过程的调控、造血祖细胞分化等；分子功能（如补体结合、血红蛋白结合等）、KEGG通路（如补体和凝血级联、胆固醇代谢、疟疾等）也显示出与铁的相关性。本研究从尿液蛋白质组学的角度有助于深入理解铁元素的生物学功能，并为铁代谢紊乱相关疾病的预防、诊断、治疗及监测提供了新的研究视角。
分类： 生物学 >> 生物化学 分类： 生物学 >> 分子生物学 提交时间： 2024-01-02
摘要： 目的：对肥胖人群与正常人群尿液蛋白质组的比较。方法：收集肥胖人群和正常人群的尿液样品，通过高效液相色谱串联质谱联用（LC-MS/MS）的非标记定量蛋白质组学技术进行鉴定。筛选肥胖人群与正常人群尿液蛋白质组的差异蛋白进行蛋白质功能和生物学通路分析；将肥胖个人与正常人群尿液蛋白质组进行比较，统计共有差异蛋白进行蛋白质功能和生物学通路分析；在肥胖个人尿液蛋白质组中检索已被报道的肥胖生物标志物。结果：肥胖人群相对于正常人群尿液蛋白质组可鉴定到38个差异蛋白，其中有些蛋白已经被报道与代谢、肥胖相关，差异蛋白富集到的生物学过程也与代谢等过程相关；肥胖个人与正常人群尿液蛋白质组比较富集到８个共有差异蛋白，其中有蛋白已经被报道与代谢、肥胖相关，差异蛋白富集到的生物学过程也与代谢等过程相关；在肥胖个人相对于正常人群尿液蛋白质组的差异蛋白中，能匹配到已被报道的肥胖生物标志物。结论：尿液蛋白质组能进行正常人与肥胖者的区分，尿液蛋白质组差异蛋白中具有已知和肥胖、代谢相关的关键蛋白，且差异蛋白能富集到营养、代谢等相关生物学过程。尿液蛋白质组具有探究肥胖发生机制、提供个性化治疗的潜力。
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