分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2023-06-05 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为研究云南马铃薯（Solanum tuberosum ）内生真菌的多样性，该文以采自云 南省德宏芒市、大理喜洲和临沧双江三个地区的马铃薯植株为研究对象，采用组织块分离法、 尖端菌丝挑取法对马铃薯根、茎及块茎中的内生真菌进行分离纯化，然后采用形态学鉴定方 法和ITS 序列分析的方法对分离得到的内生真菌进行鉴定，并对内生真菌的定殖率、分离率 及多样性指数进行计算和分析。结果表明：（1）该研究共分离得到内生真菌98 株，其中从 德宏芒市的样品中获得40 株，从大理喜洲的样品中获得27 株，从临沧双江的样品中分离 得到31 株。（2）经鉴定，分离得到的马铃薯内生真菌共涵盖10 目10 科13 属，多为子 囊菌门和担子菌门，优势菌为镰刀菌属（Fusarium ）和青霉属（Penicillium ）。褶皱裸胞 壳（Emericella rugulosa ）、接骨木镰刀菌（Fusarium sambucinum ）、毛韧革菌 （ Stereum hirsutum ） 、Psathyrella sulcatotuberculosa 和Epicoccum catenisporum 5 种真菌首次从马铃薯植株中分离得到。（3）马铃薯块茎内生真菌的定殖 率最高，根部内生真菌定殖率最低；而内生真菌的分离率以马铃薯根部为最高，茎部最低。 不同组织中内生真菌的多样性指数趋势均为根>块茎>茎。综合来看，云南马铃薯植株中的 内生真菌具有较高的多样性，不同地区的马铃薯样品中内生真菌优势菌不同，马铃薯根部具 有最丰富的内生真菌种群和最高的分离率，因此是最适合进行内生真菌分离的材料。以上研 究结果为后期探究马铃薯内生真菌对病原菌的拮抗作用奠定基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-12-19 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为探究 AP2/ERF 基因家族在油橄榄水胁迫中的应答机制，该研究对受干旱及水淹胁迫的‘佛奥’和 ‘TYZ-1 号’2 个品种的根和叶进行转录组测序，并基于全基因组数据对油橄榄中 AP2/ERF 转录因子的蛋白理化性质、基因结构及系统进化进行分析，同时通过转录组测序数据分析与水胁迫相关的 AP2/ERF 转录因子在两个油橄榄品种中的基因表达差异情况并用荧光定量 PCR 进行验证。结果表明：（1）在油橄榄中鉴定得到 110 个 AP2/ERF 基因家族成员，该 110 个蛋白质所含氨基酸大小为 173-717bp，均不存在信号肽，为非分泌蛋白，将油橄榄 AP2/ERF 与模式植物拟南芥 AP2/ERF 蛋白构建进化树，发现油橄榄 AP2/ERF蛋白分为 AP2、RAV、ERF 和 Solosist 四个大类，其中 ERF 分为 ERF 和 DREB 两个亚类，ERF 包含 ERF B1~ERF B6 六个子亚类，DREB 包含 DREB A1~DREB A6 六个子亚类，这与模式植物拟南芥 AP2/ERF 的分类一致，每个亚家族同时包含了油橄榄和拟南芥 AP2/ERF 蛋白，说明拟南芥和油橄榄的 AP2/ERF 家族在进化水平上有一定的相似性。（2）基因结构及保守元件分析中发现油橄榄 AP2/ERF 同一亚家族蛋白具有相同的基因结构及保守元件。结合基因表达和进化树中已知水分调控功能的基因初步推测OeAP2-75,OeAP2-97, OeAP2-101,OeAP2-23, OeAP2-13 与 油 橄 榄 水 分 调 节 密 切 相 关 ， OeAP2-13,OeAP2-28,OeAP2-104, OeAP2-75, OeAP2-80,OeAP2-50 在两个品种中都有不同的表达量，推测这可能是‘佛奥’和‘TYZ-1 号’抗性不同的原因。利用 RT-qPCR 技术检测油橄榄 AP2/ERF 基因在不同胁迫下的表达变化，结果显示 OeAP2-101,OeAP2-28, OeAP2-42 受水胁迫诱导显著上调，这与转录组分析结果一致。该研究结果可为油橄榄 AP2/ERF 家族基因的抗逆性表达及基因功能研究奠定基础，为油橄榄选育抗旱、耐涝砧木品种提供了方法和理论依据。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2019-10-17 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为了解降香黄檀叶绿体基因组密码子使用模式，本研究利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP对降香黄檀叶绿体基因组中的52条基因编码序列密码子进行中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析。结果表明：降香黄檀叶绿体基因组密码子的3个位置上GC含量依次为GC1 (46.01%) >GC2 (38.98%) >GC3 (27.80%)；有效密码子数(ENC)范围为37.66 ~ 54.43，及ENC值>45的有37个；RSCU >1的密码子有29个，其中16个以U结尾、12个以A结尾；这些说明其偏好以AT结尾，且偏性较弱。中性绘图分析显示GC12与GC3的相关系数0.250，相关性不显著，回归系数为0.394；ENC-plot分析显示ENC比值位于-0.05 ~ 0.15区间的基因有39个；且PR2-plot分析在碱基的使用频率方面，U > A、G > C；说明降香黄檀叶绿体基因组密码子偏好性主要受选择的影响；19个密码子被确定最优密码子。本研究为降香黄檀叶绿体基因工程、遗传多样性分析等研究提供了科学参考依据。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2019-02-25 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 由氨基酸衍生的氰苷是由植物细胞色素 P450 单加氧酶(CYP)催化氨基酸生成的次生代谢产物，与植物的防御和抗逆境胁迫相关。本研究通过分析蒜头果转录组数据，从中分离并克隆得到 1 条细胞色素 P450 基因(命名为 MoCYP71，GenBank 登录号 MK172858)，并对其进行生物信息学分析及检测该基因在果实不同发育时期的表达情况。结果显示，MoCYP71基因含 1 572 bp，编码 523 个氨基酸，该基因的 cDNA 序列与咖啡(Coffea eugenioides,XM_027319282)、小果咖啡(Coffea arabica，XM_027213456)中的 CYP71 基因的 mRNA 序列均有 88 %的一致性 ；该蛋白的相对分子质量为 58 976.54，理论等电点 pI 为 8.10，分子式为 C2675H4184N704O744S27，不稳定系数(Ⅱ)为 40.84，是一种不稳定蛋白；该蛋白不存在信号肽，存在于分泌途径，含有两个跨膜结构，分别位于 20~37 和 311~333 位氨基酸为跨膜疏水螺旋，锚定于细胞器上；MoCYP71 蛋白含有 CYP 家族的保守结构域，包括脯氨酸富集区(PPSPPRLP)、K 螺旋(KETFR)、I 螺旋(GGIDTS)、PERF 域(PERF)和识别结构域血红素结合域(FGAGRRICPG)，与可可、榴莲、高粱等的 CYP71E 家族的蛋白(GenBank 登录号分别为 EOX92908.1、XP_022773875.1 和 AAC39318.1)聚为一支；在花谢后，MoCYP71 基因表达量逐渐降低， 花谢后 1 个月>2 个月>3 个月，但在花谢后 4 个月的表达量急剧增加。本研究对研究蒜头果的对虫害的防御、组织成熟及蒜头果中有效次生代谢产物的发掘具有重要的意义。
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