分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-03-06 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为了解杜仲基因密码子使用模式，以杜仲基因组密码子为研究对象，运用CodonW软件对杜仲的320个蛋白编码基因进行同义密码子相对使用频率（RSCU）分析、ENC-GC3S关联分析编码基因的密码子ENC值、PR2-plot偏倚分析编码基因的密码子碱基使用频率。运用CUSP软件与Codon Usage Database软件对杜仲基因密码子的GC含量、使用频率与代表性物种烟草、拟南芥、大肠杆菌和酿酒酵母的密码子GC含量和使用频率进行比较。结果表明：杜仲基因密码子的RSCU>1的密码子有30个，其中18个以G/C结尾、12个以A/U结尾；说明杜仲基因密码子偏好以G/C结尾，且偏好性较强。有效密码子数（ENC)范围为30～60，该范围内的密码子距离标准曲线较近其ENC值小，偏好性较强。PR2-plot偏倚分析碱基使用频率显示G>C、U>A。杜仲与代表性物种的GC含量分析显示杜仲的GC12、GC3以及平均GC含量均高于代表性物种；杜仲与代表性物种的密码子使用频率分析表明杜仲与烟草、酿酒酵母的密码子偏好较为接近，杜仲与拟南芥、大肠杆菌的密码子偏好差距较大。杜仲是我国特有的珍贵中药材对其进行密码子使用模式分析，研究其密码子偏好规律，为杜仲植物基因工程中外源基因的改良及表达提供理论基础。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2019-03-14 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为研究播种季节及种植方式对多年生苦荞主要农艺性状的影响，本文选取6个多年生苦荞新品系，对春、秋季直播与秋季再生其主要农艺性状进行调查。结果表明：不同播种季节对多年生苦荞新品系的主花序的花粉可育率、总结实率、有效结实率、植株株高、主茎粗、主茎分枝数、主茎节数及籽粒百粒重、单株粒数、单株产量的影响均达到显著或极显著水平，秋播主花序花粉可育率、总结实率、有效结实率，植株主茎分枝数，籽粒百粒重、单株粒数、单株产量均极显著高于春播；植株株高、主茎粗、主茎节数均极显著低于春播，主花序花朵大小、籽粒种子长宽比无显著差异。不同种植方式对主花序花粉可育率、有效结实率，植株主茎节数及籽粒百粒重的影响达到显著或极显著水平。秋季再生主花序花粉可育率、籽粒单株粒数显著高于秋季直播，主花序有效结实率，植株主茎粗、主茎节数，籽粒百粒重显著低于秋季直播，主花序花朵大小、总结实率，植株株高、主茎分枝数，籽粒种子长宽比、单株产量无显著差异。相关分析表明，各生长季节下主花序有效结实率及单株粒数与单株产量的相关系数均是最高。所有参试品系中，1612-241秋季直播的单株产量显著高于其他品系；1612-16、1612-33秋季再生单株产量较正季优势显著。该研究结果有助于筛选出适宜一季播种两季收获的优良品系，为今后多年生苦荞的选择育种提供线索基础。
分类： 生物学 >> 生物工程 提交时间： 2018-11-08 合作期刊: 《中国生物工程杂志》
摘要： 摘要【目的】对美洲大蠊内生粘质沙雷氏菌几丁质酶ChiA基因进行克隆、可溶性表达及功能验证。【方法】PCR扩增ChiA基因，TA亚克隆，构建重组表达载体ChiA/pET21b，生物信息学分析和低温诱导表达、SDS-PAGE、Western-Blot鉴定，打孔法对几丁质酶活性检测。【结果】PCR成功扩增了ChiA基因序列，该序列与Gen Bank上的S．marcescens ChiA基因序列同源性达99%；该序列编码571个氨基酸，并能够在原核系统中稳定表达。可溶性表达分析显示：通过低温诱导表达，获得可溶性的目的蛋白；活性试验发现:含目的蛋白的表达产物可分解几丁质，且活性强于美洲大蠊内生粘质沙雷氏菌。【结论】从美洲大蠊内生粘质沙雷氏菌基因组中成功克隆了几丁质酶ChiA基因，通过原核表达系统获得了具有较强活性的可溶性几丁质酶ChiA，为其应用奠定了基础。
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