Subjects: Biology >> Bioengineering submitted time 2019-01-17 Cooperative journals: 《中国生物工程杂志》
Abstract：细菌中普遍存在L/D型氨基酸，与L-氨基酸（L-AAs）不同，D-氨基酸（D-AAs）不参与蛋白质合成，而与细胞壁肽聚糖的合成有关，直接影响细菌细胞壁的形状、数量和强度。D-AAs在细菌表征、药物抑菌性、靶标确定等方面具有重要的作用。目前，外源添加D-AAs参与肽聚糖合成的机制已有一些研究进展，其荧光衍生物已应用于细菌可视化，特异性探测细胞壁形成/重塑、细菌生长和细胞形态。但D-AAs如何影响细菌生长及其抗逆性的机制尚未研究清楚。本文对D-AAs的研究现状进行了综述，重点介绍了D-AAs在细菌中的生物合成和参与细胞壁合成的机制，非典型D-AAs对细菌的调控以及在细菌可视化中的应用，并对D-AAs未来研究方向进行了展望。
Subjects: Biology >> Bioengineering submitted time 2018-05-23 Cooperative journals: 《中国生物工程杂志》
Abstract：在细菌生长过程中,细胞壁起到维持细胞形状和完整性，抵抗内部膨胀压的作用。细胞壁的合成、分裂、再生、循环再利用等与细菌自身生长繁殖和应对环境压力息息相关。目前，细胞壁生长机理，细菌如何调控细胞壁生长及如何与其他细胞过程相协调的机制尚未研究清楚。细胞壁调控机制的解析对了解细菌细胞壁功能、确定药物的作用方式和发展新一代的治疗方法至关重要。本文对细菌调控细胞壁生长机制的国外研究进展进行了概述，重点阐述了支架蛋白、转录因子、非编码小RNA及蛋白相互作用调控细胞壁的合成、细胞分裂、压力响应的机制，总结了细胞壁调控机制在抗菌药物研发中的应用，并对未来的研究方向进行了展望。
Subjects: Biology >> Bioengineering submitted time 2018-04-19 Cooperative journals: 《中国生物工程杂志》
Abstract：细菌脂蛋白是细胞膜的重要组成部分，对细菌发挥各种生理活性起重要作用，与营养摄取、环境感知、细胞膜和细胞壁稳态的维持、蛋白质的折叠和定位等过程密切相关。随着生物技术不断发展和完善，越来越多的脂蛋白种类及功能被发现。本文综述了革兰氏阳性菌中脂蛋白的功能、生物合成过程和应用方面的研究进展，重点介绍了脂蛋白生物合成过程中关键酶磷脂酰甘油转移酶（Lipoprotein diacylglyceryl transferase，Lgt）和脂蛋白信号肽酶（Lipoprotein signal peptidase II，LspA）对革兰氏阳性菌生理活性产生的影响，为今后革兰氏阳性菌脂蛋白的研究提出了展望和建议。
Subjects: Biology >> Bioengineering submitted time 2018-04-19 Cooperative journals: 《中国生物工程杂志》
Abstract：CRISPR/Cas9系统已不仅仅是一种革命性的基因编辑工具，还能在各种原核和真核生物中调控基因转录。近年来，由CRISPR/Cas9衍生而来的CRISPR-dCas9系统已被用于基因成像、高通量筛选、基因调控、必需基因功能研究及表观遗传调控等多个方向。本文总结了近年来CRISPR-dCas9系统在激活或抑制基因转录、降低脱靶效率、sgRNA与转录强度及特异性之间的联系等方面的研究进展，以期对CRISPR-dCas9系统定向调控基因转录的研究提供参考和帮助，并就其未来可能的改进进行了展望。
Subjects: Biology >> Bioengineering submitted time 2017-11-21 Cooperative journals: 《中国生物工程杂志》
Abstract：嗜酸菌是一类可以在极端酸性环境下生存的微生物，在生物整治以及耐热耐酸酶的提取等领域发挥着重要作用。一些嗜中性工程菌株在发酵过程中经常遇到自身环境酸化的问题，嗜酸菌独特的耐酸能力及其耐酸模块为构建耐酸能力强的嗜中性工程菌株提供了思路。因此，从细胞膜的稳定性及低渗透性，耐酸相关的能量代谢，生物大分子的修复以及胞内缓冲作用等方面对嗜酸菌的耐酸机制进行深入探讨，并展望了嗜酸菌在耐酸工程菌株合成生物学邻域的作用。
Subjects: Biology >> Bioengineering submitted time 2017-11-21 Cooperative journals: 《中国生物工程杂志》
Abstract：嗜酸菌是一类可以在极端酸性环境下生存的微生物，在生物整治以及耐热耐酸酶的提取等领域发挥着重要作用。一些嗜中性工程菌株在发酵过程中经常遇到自身环境酸化的问题，嗜酸菌独特的耐酸能力及其耐酸模块为构建耐酸能力强的嗜中性工程菌株提供了思路。因此，从细胞膜的稳定性及低渗透性，耐酸相关的能量代谢，生物大分子的修复以及胞内缓冲作用等方面对嗜酸菌的耐酸机制进行深入探讨，并展望了嗜酸菌在耐酸工程菌株合成生物学邻域的作用。
Subjects: Biology >> Bioengineering submitted time 2017-06-01 Cooperative journals: 《中国生物工程杂志》
Abstract： Metabolic engineering in bacteria requires optimization of gene expression levels to balance metabolic flux distributions and minimize accumulation of toxic intermediates towards an efficient biosynthesis of target products. Small non-coding RNAs (sRNAs) in bacteria can interact with their target mRNA by base-pairing to inhibit or activate the translation of their target genes. Since small RNAs play critical regulatory roles in many physiological processes, they are considered to be powerful tools for the tuning of target genes expression in bacterial metabolic engineering. Many artificial sRNAs are applied in metabolic engineering in recent years. In this review, identification of sRNA targes genes, interaction between sRNAs and their targets and application of sRNAs in metabolic engineering were summarized.
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