莪术基原植物DNA 条形码序列的筛选与鉴定

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-03-24 合作期刊: 《广西植物》

张玉秀 刘杨 刘培卫 符传坤 卢丽兰 魏建和

摘要： 为了寻找适用于中药材莪术基原植物鉴定的DNA 条形码序列，探索快速高效的莪术基原植物鉴定的新方法，该文首先利用扩增成功率和测序成功率对中药材莪术3 种基原植物，9 个样本的7 种DNA 条形码序列（ITS、ITS2、matK、psbA-trnH、trnL-trnF、rpoB 和atpB-rbcL）进行评估，然后利用MEGA6.0 软件对获得的高质量的序列通过变异位点分析、遗传距离计算和系统树分析等进一步进行评估，最后我们还将筛选到的DNA 条形码序列对未知基原的待测样品进行基原鉴定。结果显示，ITS、ITS2 和matK 等条形码序列在莪术基原植物中的扩增或测序成功率低，难以应用于实际鉴定，而psbA-trnH、trnL-trnF 和rpoB等条形码序列变异位点信息过少，不足于区分莪术的3 种不同基原植物，只有atpB-rbcL 条形码序列的扩增和测序成功率高，容易获得高质量的序列，同时序列长度理想（642～645bp）,变异位点多（11 个），可实现莪术的3 种不同基原的区分鉴别。待测样品经基于atpB-rbcL序列构建的系统发育树鉴别为温郁金。实验结果表明，叶绿体atpB-rbcL 序列能够准确鉴定莪术不同基原植物，可以作为中药材莪术基原植物鉴定的条形码序列。

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