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1. chinaXiv:202009.00036 [pdf]

纤枝短月藓 BeLEA2 基因的克隆及表达分析

李雪宝; 王琦; 鄢波
Subjects: Biology >> Botany >> Applied botany

为探究纤枝短月藓?LEA2 基因的结构和表达特征,该研究以纤枝短月藓为材料,首次利用?PCR 克隆技术得到纤枝短月藓?BeLEA2 基因序列,对该基因进行分析。结果表明:该基因序列中含有?2 个外显子和?1 个内含子,其开放阅读框(ORF)为 456 bp,编码?151 个氨基酸,预测其相对分子质量为?16 515.96 Da。将纤枝短月藓与其他植物?LEA2 基因氨基酸序列进行比对,构建系统进化树,结果显示纤枝短月藓与小立碗藓的亲缘关系最近。利用HiTail PCR 技术克隆获得?1 072 bp 的?BeLEA2 启动子序列,用?PlantCARE 在线工具对该启动子的顺式作用元件进行预测,结果表明该启动子除了含有核心启动子元件?TATA-box 和CAAT-box 外,还含有?ABRE、MYB、MYC、MYB 结合位点(MBS)等其他顺式元件。实时荧光定量?PCR 分析表明,BeLEA2 基因在纤枝短月藓不同发育时期和不同组织中都有表达,且对脱水胁迫有响应。以上结果为进一步探究?LEA2 基因在苔藓植物中的功能及作用机制奠定了基础。

submitted time 2020-09-15 From cooperative journals:《广西植物》 Hits193Downloads92 Comment 0

2. chinaXiv:201803.01081 [pdf]

黄萎病不同发生程度棉田中土壤微生物多样性

刘海洋,姚举,张仁福,王伟,余璇,王琦
Subjects: Biology >> Ecology

作物根际土壤微生物群落对土壤生态及作物健康至关重要。以棉花黄萎病不同发生程度棉田的土壤为研究对象,采用理化分析、微生物纯培养及高通量测序技术对土壤理化性质及微生物数量、细菌丰度多样性进行综合分析。结果表明:在纯培养条件下,大丽轮枝菌无菌发酵滤液对细菌生长有明显的抑制作用;棉田接种大丽轮枝菌对土壤中细菌、真菌、放线菌的数量及细菌菌群丰度多样性未产生明显影响,不同采样时间的土壤中细菌菌群结构差异更大。土壤中大丽轮枝菌微菌核数量与棉花黄萎病的发生程度呈显著正相关。土壤肥力对土壤中微生物数量起主导作用,而水稻-棉花轮作能够使棉田有效降盐、减病、改善土壤肥力。通过生物防治、作物轮作、深翻等调控措施增加土壤中有益菌群数量、改善土壤生态、降低棉田土壤中大丽轮枝菌菌源数量是减轻棉花黄萎病危害的基础。

submitted time 2018-03-14 From cooperative journals:《生态学报》 Hits539Downloads315 Comment 0

3. chinaXiv:201801.00058 [pdf]

垄沟集雨系统Laio土壤水分动态随机模型参数敏感性分析及优化

尹鑫卫;李晓玲;王琦;张永梅
Subjects: Biology >> Ecology

水文模型参数的敏感性分析、优化和验证对提高模型率定效率和计算精度具有重要意义。为探讨Laio土壤水分动态随机模型(Laio模型)各参数在垄沟集雨系统的敏感性, 同时确定参数优化和模型验证的最佳方案, 本文结合多因素敏感性分析法以及改进单纯形法(ISM)、粒子群优化算法(PSO)和混合粒子群优化算法(HPSO), 利用中国气象局定西干旱气象与生态环境试验基地2012-2013年垄沟集雨燕麦生长季降雨、径流和土壤水分等实测数据, 对垄沟集雨系统Laio模型的13个参数进行敏感性分析、优化和验证。结果表明, 平均降水量 和凋萎系数sw对土壤水分概率密度函数 最敏感, 且 对参数 的敏感性在低土壤含水率下更明显, 而对参数sw的敏感性在高土壤含水率下更明显; 3种算法(ISM、PSO和HPSO)的优化参数值均能对垄沟集雨系统土壤水分概率密度函数进行较好模拟, 其峰值(CPV)、峰值位置(PP)和95%置信区间(CI95%)实测值与模拟值的相对误差均小于10%, CM指数均大于0.5; 同时, HPSO算法优化参数的模拟效果和收敛速度均显著优于PSO算法和ISM算法, 且能较显著克服ISM算法和PSO算法存在的缺陷。故HPSO算法可作为垄沟集雨系统土壤水分动态随机模型参数优化的待选方案。该研究可为Laio模型的区域应用和模型调参提供科学指导依据。

submitted time 2018-01-05 From cooperative journals:《中国生态农业学报》 Hits2862Downloads513 Comment 0

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